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- CH68453622 2016-04-30 00:00:00
- 现在全基因组测序用鸟枪法,把所有DNA打碎成短片段,测出所有片段的序列再用超级计算机进行拼接。你说的是老方法,先构建大的长片段文库,这些长片段互相重叠,能涵盖全部基因组,即所谓的骨架scaffold。然后在对文库里每一个克隆进行亚克隆,应该还进行亚亚克隆,得到可以直接测序的短片段克隆,即所谓的可以测序得到Reads的克隆。每个Reads的序列拼接起来,逐级拼接,Z后得出每一个长片段克隆的序列,Z后进行长片段克隆的拼接,得到每一条染色体的序列。实际上老方法就是分级克隆,再拼接,鸟枪法就是直接得到短片段,不经过克隆,对短片段直接测序、拼接。人类基因组计划Z初使用老方法,后来一个公司使用了鸟枪法,Z后两种方法同时完成。
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