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四代测序技术到来 – 罗氏收购GeniaTechnologies测序公司

罗氏诊断产品(上海)有限公司 2019-07-03 14:25:10 245  浏览
  • 6月2日,罗氏宣布将出价3.5亿美元收购一家测序公司GeniaTechnologies,其中包括向Genia股东支付1.25亿美元现金,以及后续根据进展支付累积至2.25亿美元。完成收购后,Genia公司将与罗氏测序部门整合。

    Genia公司的CEO Stefan Roever曾说“如果二代测序是需要前期DNA扩增的电子传导技术,三代测序是光信号捕获的单分子测序,那么我们就是四代测序技术单分子测序+电子传导检测”。

    罗氏测序部门总裁 Dan Zabrowski说,“我们相信Genia公司的技术将为测序市场带来全新概念的的富有竞争力的产品。通过单分子测序和电子传感器捕获信号,Genia公司的测序技术将在提高速度和灵敏度的同时极大地降低测序成本。相比现有二代测序平台,将会避免DNA扩增所引入的碱基偏好和错误,带来更长的测序读长;而与其它同类测序技术相较而言,NanoTag测序和电子传感器捕获信号技术,可准确检测皮安级别的电流信号差异,可以从技术上解决目前技术瓶颈,提高结果准确性与测序通量。”

    罗氏一直致力于为所有用户提供前沿的、有别于二代测序的产品和服务,同时也一直在为基因组领域中测序技术的革新以及临床价值的传递提供解决方案。2007年,罗氏收购了diyi家二代测序公司454 Life Science,同年还收购了NimbleGen做为二代测序上游DNA序列捕获解决方案,2013年,与单分子测序公司Pacific Biosciences合力推进单分子测序在临床检测上的解决方案。今年对Genia公司的收购更加证明了罗氏在不断丰富和多元化测序产品上的决心。罗氏Dan Zabrowski也表示,还将继续推出支持个性化定制的DNA富集SeqCap EZ Library产品,为用户提供更加完善的测序解决方案。


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四代测序技术到来 – 罗氏收购GeniaTechnologies测序公司

6月2日,罗氏宣布将出价3.5亿美元收购一家测序公司GeniaTechnologies,其中包括向Genia股东支付1.25亿美元现金,以及后续根据进展支付累积至2.25亿美元。完成收购后,Genia公司将与罗氏测序部门整合。

Genia公司的CEO Stefan Roever曾说“如果二代测序是需要前期DNA扩增的电子传导技术,三代测序是光信号捕获的单分子测序,那么我们就是四代测序技术单分子测序+电子传导检测”。

罗氏测序部门总裁 Dan Zabrowski说,“我们相信Genia公司的技术将为测序市场带来全新概念的的富有竞争力的产品。通过单分子测序和电子传感器捕获信号,Genia公司的测序技术将在提高速度和灵敏度的同时极大地降低测序成本。相比现有二代测序平台,将会避免DNA扩增所引入的碱基偏好和错误,带来更长的测序读长;而与其它同类测序技术相较而言,NanoTag测序和电子传感器捕获信号技术,可准确检测皮安级别的电流信号差异,可以从技术上解决目前技术瓶颈,提高结果准确性与测序通量。”

罗氏一直致力于为所有用户提供前沿的、有别于二代测序的产品和服务,同时也一直在为基因组领域中测序技术的革新以及临床价值的传递提供解决方案。2007年,罗氏收购了diyi家二代测序公司454 Life Science,同年还收购了NimbleGen做为二代测序上游DNA序列捕获解决方案,2013年,与单分子测序公司Pacific Biosciences合力推进单分子测序在临床检测上的解决方案。今年对Genia公司的收购更加证明了罗氏在不断丰富和多元化测序产品上的决心。罗氏Dan Zabrowski也表示,还将继续推出支持个性化定制的DNA富集SeqCap EZ Library产品,为用户提供更加完善的测序解决方案。


2019-07-03 14:25:10 245 0
注资Stratos Genomics 罗氏再度投身四代测序研发

  继2014年5月罗氏收购第四代测序公司Genia Technologies之后,罗氏近期宣布将对Stratos Genomics公司进行策略性投资以及研究上的合作。目前罗氏已投入了500万美元的diyi笔资金,支持Stratos公司开发其独特的化学工艺,用于通过纳米孔进行DNA单分子测序。

  与罗氏之前投资的两项单分子测序技术(Pacific Biosciences公司的ZMW技术与Genia公司的Nano-tag技术)不同,Stratos Genomics公司在研发的是一种叫做“边扩大边测序”(“SequencingByExpansionTM”,SBXTM)的技术。

上图为XpandomerTM分子

  该方法将DNA转换成一个更大的“替身”分子,这个大分子被称为XpandomersTM,再通过检测这个“替身”分子来测定原始的DNA序列。这些XpandomersTM大分子,比原始的DNA长10-100倍,由多个“高信号值”的报告分子组成,这些报告分子排列对应原始DNA碱基序列。XpandomersTM分子穿过纳米孔时,不同报告分子产生不同信号而被检测,从而可获得原始DNA序列。XpandomersTM由聚合酶合成,以DNA为模板,利用一种可伸长的特殊核苷酸合成“替身”分子XpandomersTM,再通过一个快速的化学反应拉长“替身”分子的长度,再通过纳米孔进行测序。这种报告分子由于比其对应的碱基分子长10-100倍,可以使得通过纳米孔时所引起的电信号改变更加显著,信噪比更好,从而提高单碱基的分辨率及读取的准确性。

  罗氏一直致力于为所有用户提供前沿的、有别于新一代测序的产品和服务,同时也一直在为基因组领域中测序技术的革新以及临床价值的传递提供解决方案。2007年,罗氏收购了diyi家二代测序公司454 Life Science,同年还收购了NimbleGen做为二代测序上游DNA序列捕获解决方案,2013年,与单分子测序公司Pacific Biosciences合力推进单分子测序在临床检测上的解决方案,今年上半年罗氏也宣布收购Genia公司进军四代测序技术。

  在单分子测序方面,Stratos Genomics公司特有的技术能够补充之前投资的两项单分子测序技术,尤其Genia公司纳米孔测序技术可以更好地结合,为更广泛领域的测序应用提供解决方案。罗氏坚信这三种单分子测序技术在诸如成本、速度、准确性及灵活性等方面各有其擅长之处,有望在测序市场引发突破革命。

2019-07-03 14:25:10 325 0
罗氏454测序参与棉花基因组进化研究工作

棉花是重要的经济作物之一。它的纤维,俗称皮棉,是纺织工业主要的天然原料。全世界棉花种植面积约5亿亩,我国常年种植面积近8千万亩。棉花不但是重要的纤维和油料植物,而且是重要的植物蛋白来源。在食用油中,棉籽油的亚油酸含量Z高,达到55.6%。除此以外,棉花种子中还含有极为丰富的蛋白质和脂肪等物质,棉籽榨油后的棉籽粉蛋白质高达45%50%,远胜过大米、小麦,甚至超过花生、大豆的蛋白质含量。然而,由于一般栽培棉品种的种子和植株具有色素腺体,而色素腺体中含有的棉酚及其衍生物对人和单胃动物有毒,棉酚是棉属植物特有的化合物,这直接制约了棉籽作为食物资源的开发和利用。


近日,来自8个国家的70多名科学家共同参与的国际合作项目----棉花基因组测序完成。该研究的学术文章《棉花基因组的多倍化及纤维的发育》发表在《自然》杂志上。研究中,科学家们结合传统的Sanger测序与新一代454测序技术对雷蒙德氏棉基因组进行了组装工作,获得了其87.7%的全基因组序列,通过比较基因组以及进化分析发现,雷蒙德氏棉约在13002000万年前经历了一次全基因组复制事件。这次复制事件很可能不是雷蒙德氏棉的diyi次基因复制,早在约1亿多年前,雷蒙德氏棉就可能经历了一次基因组复制事件。这些研究结果有利于人类认识古双子叶植物基因组的复制机制。经过雷蒙德氏棉基因组自身比对后,科研人员共鉴定出了2355个共性区域,并发现约有40%的旁系同源基因出现在不止一个共性区域,这表明了雷蒙德氏棉基因组在进化过程中可能经历过大量的染色体重排事件。
自2008年以来,棉花全基因组测序成为棉花基础研究领域的热点问题。下一步要在该成果基础上开发出快捷分子育种工具,实现基因组水平上的棉花分子设计育种,培育出高产、高质、抗病抗旱的棉花优良新品种。分子辅助设计育种和常规育种相结合是未来作物育种研究的必然发展方向,建立在基因组学研究基础上的分子辅助设计育种,因分子标记数量巨大、且不受基因表达时间、显隐性关系和环境条件的影响,大大提高了育种选择的准确性,缩短了育种周期,提高了选择效率。

参考文献:Repeated polyploidization of Gossypium genomes and the evolution of spinnable cotton fibres. NatureVolume:492,Pages:423427Date published:(20 December 2012)DOI:doi:10.1038/nature11798

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圆满结束 | 2020年新一代测序NGS技术培训班

2020年9月18日-19日,由ZG遗传学会遗传诊断分会和上海市临床检验ZX主办,上海市遗传学会、同济大学附属上海肺科医院、国家卫健委出生缺陷与生殖健康ZD实验室、基因技术教育部工程研究ZX协办的“2020年新一代测序NGS技术培训班暨第三届全国NGS建库技能大赛”在上海五角场凯悦酒店隆重召开。本次培训班旨在规范NGS从业人员的操作流程并提高NGS从业人员的专业技能和理论知识,为NGS行业的发展打下坚实的基础。


本次大会由复旦大学生命科学学院副院长、上海市遗传学会理事长卢大儒教授作培训班开幕致辞。卢教授总结了ZG测序行业的发展历史,展望了NGS行业未来的发展方向,并给在座NGS从业人员传授了诸多行业经验和专业建议。随后的两天时间里,上海交通大学附属瑞金医院王升跃主任、复旦大学遗传学博士/上海韦翰斯生物医药科技有限公司创始人杨敬敏老师、复旦大学生命科学学院田卫东教授、上海市临床检验ZX分子病理研究室肖艳群主任、上海市人类基因研究ZX施锦绣研究员、复旦大学生命科学学院全哲学教授等众多业内大咖给培训班学员们作了精彩授课。

王升跃主任以“NGS测序原理及实验流程概述”为题,详细讲述了一代、二代、三代测序的发展历史、测序原理以及实验流程,强调了测序中质控的重要性,在其授课的文案中提到了用Qsep系列核酸蛋白分析系统做NGS相关质控,进行了结果的展示杨敬敏老师的授课内容是“NGS文库构建与质控流程”,讲解了NGS文库构建过程中,gDNA、RNA、片段化样本、文库等各类样本的质量控制方法与重要性,并在讲解过程中推荐了Qsep系列核酸蛋白分析系统作为文库质控设备;田卫东教授的报告内容为生物信息学辅助诊断单基因遗传病,给学员们介绍了各类数据库、数据网站以及生物信息学软件;肖艳群主任ZD介绍了NGS实验室各个分区的设置方法以及检测样本的质量控制;全哲学教授则讲解了人体微生物基因组的相关研究以及宏基因组测序的一些具体案例。每位老师的授课内容都非常精彩且干货满满,让学员真正学到了NGS相关的实验技能和理论知识,并且体会到了NGS技术的重大意义。


杭州厚泽生物科技有限公司作为此次培训班的赞助商之一,携Qsep100全自动核酸蛋白分析系统,Qsep1便携式生物片段分析仪、Qsep400全自动核酸蛋白分析系统等产品进行展出,吸引了众多老师和学员的参观和咨询。复旦大学生命科学学院全哲学教授也莅临杭州厚泽展位参观,并对Qsep系列全自动核酸蛋白分析系统表达了极高兴趣。Qsep系列全自动核酸片段分析仪在核酸和蛋白质控领域具有高分辨率、高灵敏度、通量灵活、性价比高和操作简便等特点,让NGS客户的质控流程变得gao效且jing准,广受客户好评。


杭州厚泽生物科技有限公司是一家集科学仪器、耗材、试剂销售,推广和售后服务为一体的高科技生物企业,为各大科研研究所、医院、检测机构等提供专业的核酸提取、质控一体化设备解决方案,用优质的服务在客户群树立了良好的口碑。公司以“用户至上,用心服务”为核心价值,始终把满足客户需求,提供全面服务作为服务宗旨。

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