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- Snoworlove 2017-11-02 00:00:00
- 一般通过总量,纯度与完整性三大项检测来确认RNA质量: 1总量:微量分光光度计测260nm吸收值计算。 2纯度:微量分光光度计测260nm/230nm吸收值的比值,用于评估有机溶剂残留;260nm/280nm吸收值的比值,用于评估蛋白质污染比例。 3完整性:以Agilent Bioanalyzer进行毛细管电泳(capillary electrophoresis),并以软件的RIN(RNA Integrity Number)分数评估,10为RNA完整性Z好,0为Z差。 RNA质检参数中260、280、320、230nm下的吸光度分别代表了核酸、蛋白质、盐浓度和有机溶剂的值。其中: A230: 测定其它碳源物质,如酚,糖类等。 A260:核酸的吸收峰测,测RNA,DNA,引物等的浓度用的。 A280:蛋白质的吸收峰。 一般的,我们只看OD260/OD280(Ratio,R)在1.8~2.1范围内时,我们认为 RNA中蛋白的污染是可以容忍的,不过要注意,当用 Tris 作为缓冲液检测吸光度时,R 值可能会大于 2(一般应该是<2.2的)。当R 1.8时,溶液中蛋白的污染比较明显,可以根据自己的需要决定这份RNA 的命运。当R > 2.2时,说明RNA已经水解成单核酸了,而纯RNA的OD260/OD280的比值为2.0。
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实时荧光定量PCR技术是通过测定RNA的转录水平来评估基因的活力。RNA样本提取的质量直接影响基因表达分析。影响RNA品质的因素有以下三种:RNA浓度、RNA纯度和RNA完整性。
检测RNA浓度、纯度和完整性的方式主要有以下几种:
紫外分光光度计法:
测量260nm吸收值计算RNA浓度,测量260nm/280nm吸收值的比值,用于评估RNA纯度。需要注意的是:在检测核酸物质时应该在固定的PH溶液中进行。
260nm/280nm的比值范围在 1.9~2.1 之间。<1.9,说明有蛋白质残留;>2.1,说明RNA可能发生降解。
琼脂糖凝胶电泳:
完整的RNA通常有三条带,最亮的是28S条带,其次是18S条带,最淡的是5S条带(部分试剂盒提取时会过滤掉5S条带)。通过琼脂糖凝胶电泳可以检测28S和18S的比值。该方法主要用于检测RNA的纯度和完整性。
如果28S和18S条带明亮、清晰、条带锐利,28S的亮度在18S条带的两倍以上,我们认为RNA的质量好。
若RNA条带出现弥散,原因可能:RNA被核酸酶降解、电压或电流过大、上样量过高或过低等。
上述两种方法在实验室比较常用,此外还有几种检测方式供大家选择。
荧光染料检测:
通过荧光染料和RNA结合,荧光活性增强。此方法的灵敏度较高,主要用于检测RNA的浓度。
微毛细管电泳:
可使用软件的RIN(RNA Integrity Number)分数评估,10为RNA完整性好,0为最差。此方法的灵敏度和分辨率较高,可用于检测RNA浓度、纯度和完整性。
3’-5’完整性检测:
是在一个RNA样本中检测GAPDH mRNA的完整性来代表所有RNA的完整性,主要用于检测RNA的完整性。
得到高品质RNA的小建议:
1、尽量避免RNA酶污染,使用无RNA酶的耗材和试剂,建议将扩增前后的场所分开。
2、尽量减少采样时间,样品处理后快速冷冻,可以加入RNA保护剂。
3、RNA提取过程中可以使用RNA酶YZ剂。
4、存储过程中避免反复冻融。
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氢氧化钠 (NaOH),也称为苛性钠,是一种强碱,极易溶于水。
当NaOH溶解在水中时,
它会形成碱性溶液,
并且是工业中常用的强碱之一。
对于 NaOH 水溶液,浓度与密度或声速值之间存在很好的相关性。这样一来,通过测量密度和声速,就可以获得精确的浓度测量值 (图 1)。
NaCl 的电解是Z重要的苛性钠生产方式,其中膜电池工艺是Z新的技术,其简易工艺流程图见下方 (图 2)。
从上图中我们发现, 25-32% 浓度的 NaOH 离开电解槽,并且必须通过测量密度 (D) 或声速(S) 来维持安全浓度,避免对膜产生损坏。在蒸发步骤中,由密度传感器控制,将 NaOH 溶液进一步浓缩至约 50%。
大多数生产的 NaOH 以 50% 的水溶液进行交易和运输,但其他浓度也可进行商业交易。在运输 NaOH 时,必须控制货物的质量以及卸载的安全性。通过在输送到储罐之前,测量运输液体的密度或声速,即可保证这两点。通过在整个交付过程中进行连续浓度测量,就可以很容易地检查供应商是否按照合同交付。安装在化工厂加注站的 L-Dens 7400 + Pico 3000 可用于控制卡车交付。
对于许多工艺,经过高度浓缩的化学品都是通过卡车输送并储存在不同的罐中。并在使用前将它们稀释至所需浓度。其简易的工艺流程如下所示:
通过测量密度 (D) 或声速 (S),即可参照所需的浓度和精确度,控制稀释过程。一个示例应用就是饮料或食品制造商对于 CIP 化学品的稀释。
由于 NaOH 溶液的强碱性质,需要使用特殊的材料和仪器。安东帕提供两种设置,专为在线测量二元 NaOH 溶液的浓度而设计。
·NaOH 密度监测仪:L-Dens 7400 INC 版本 + Pico 3000 模拟版本
·NaOH 声速监测仪:L-Sonic 5100 MON 版本 + Pico 3000 模拟版本
就使用 L-Dens 7400 INC 版本密度传感器对 NaOH 溶液进行连续密度测量。该传感器采用 Incoloy 825 制成的接液部件,可以直路或旁路安装在主线上可以删除了。
使用 L-Sonic 5100 MON 版本测量 NaOH 溶液的声速。该传感器采用 Monel 400 制成的接液部件,使用 DN 50 或 ANSI 2” 法兰直路连接管道或搅拌容器。
对于这两种设置,都使用 Pico 3000 变送器自动计算温度补偿浓度值。
针对NaOH溶液测量规范以及参数如下:
安东帕创建于1922 年,总部位于奥地利。安东帕在密度和浓度的测量,溶解二氧化碳的测定,以及在流变学和粘度测量领域处于世界ling先地位。致力于为工业和科客户提供Z合适的仪器,产品范围涵盖密度计、微波消解仪、微波合成仪、旋光仪、折光仪、黏度计、流变仪、馏程分析仪、闪点测试仪、x射线结构分析、固体表面电位分析仪、表面力学性能测试仪器、在线分析检测仪表、颗粒特性分析、原子力显微镜以及固体材料直接表征等。
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