全部评论(1条)
-
- 三亚悦来旅馆 2017-09-27 15:21:24
- “普通的基因测序”应该是指“常规DNA测序”吧,是用Sanger法(也就是双脱氧法)进行测序的方法,目前非常普遍的是直接用ABI 3730xl 进行的自动测序,基本上可以做到600bp-800bp的读长。 高通量测序的概念其实是一个相对的概念,在2000年的时候,3700、MegaBace等仪器上的测序也是高通量测序,是相对手工测序或者跑平板胶来说的。 不过到2005年以后,高通量测序就改指第二代测序(Next generation sequencing),454、Solexa(后改为Illumina)和SOLiD等第二代测序,比3730等diyi代测序的通量提高了成千上万倍,甚至上亿倍,所以称为高通量测序。 NGS的特点主要有: 1、通量高。一个RUN能产生500Mb-600Gb的数据量。 2、读长相对较短。454(约400-500bp),llumina(100-250bp),SOLiD(75-100)。 3、单位数据的成本非常低。现在很多项目测序的费用。已经非常低。生物信息分析成本变得更为重要了。
-
赞(16)
回复(0)
热门问答
- 什么是普通的基因测序,它和高通量测序有什么区别吗
2017-05-11 05:28:19
347
1
- 什么是普通的基因测序,它和高通量测序有什么区别吗
2017-03-05 06:48:15
618
1
- 什么是普通的基因测序,它和高通量测序有什么区别吗
2017-09-27 04:51:33
384
1
- 深度测序和普通的二代测序有什么区别?有什么应用
有两种体细胞突变容易被忽视bai,一种是局限在特定组织的突变。举例来说,如果突变只存在于大脑,而我们检测的是血液,那就找不到这些致病突变。另一种致病性体细胞突变虽然发生在所有组织中,但是只影响一部分细胞,因此不容易被检测到。
普通的二代测序,全基因组或外显子组测序是将DNA分成小片段,然后对各个片段多次读取(一般是三十次)。然而,如果突变只发生在15-20%的细胞中,三十次读取还不足以可靠地捕捉到它们,尤其是当突变只影响一个基因拷贝时。
Walsh和博士后Saumya Jamuar通过“定向高覆盖度测序”技术,为158名脑部疾病的患者鉴定致病突变,这些患者的症状包括癫痫、智力障碍、语言障碍等。
研究人员并没有分析整个基因组或外显子组(所有蛋白编码基因),而是把注意力放在一系列已知或有嫌疑的基因上,并且大大提高了测序的深度。
在一些疾病如唐氏综合征中,嵌合突变相较于影响全身细胞的突变,产生的症状要轻一些。但是很少量的变异细胞就足以引发损害人身心健康的症状,在以往的研究中,为了从普通基因组中检测到这些突变,研究人员就不得不增加测定的序列数量。而对少数候选基因区域进行的平均300次深度测序,就可以有效辨别被误认为测序错误的突变。
2020-10-23 15:49:28
541
0
- 高通量基因组测序中,什么是测序深度和覆盖
2017-12-19 06:15:31
567
1
- 请问什么叫硬编码,它和普通编码有什么区别?
2009-08-05 06:54:10
365
4
- 高通量基因测序用于临床需要什么资质
2018-11-14 20:51:31
328
0
- 16S测序和宏基因组测序有什么区别
2017-06-12 07:29:18
817
1
- 高通量测序技术 中的“高通量” 是什么意思
2012-10-14 00:07:39
919
4
- 高通量测序分的原理
2017-08-22 13:02:28
238
1
- 基因组高通量测序的原理
2018-12-05 11:01:40
220
0
- 什么是电磁启动器?它的构造?和接触器有什么区别?
2018-04-21 09:56:23
322
1
- 什么是硬脂肪酸,它和软脂肪酸有什么区别?
- 计算每克硬脂肪酸彻底氧化产生的自由能!... 计算每克硬脂肪酸彻底氧化产生的自由能! 展开
2013-04-01 15:48:00
1274
2
- 全基因组重测序和基因组测序有什么区别
2015-06-09 18:13:40
679
1
- 为什么高通量测序dna是深度,rna测序是多少m
2017-08-04 23:16:33
600
1
- 高通量基因测序需要什么资质才能用于临床
2016-03-30 12:09:38
414
1
- 什么是高脚烧杯?和普通烧杯有什么区别?
- 实验中经常见到高脚烧杯,是普通玻璃烧杯吗?还是有区别的?如果有区别,是容量大小的差别,还是同样容量只是形状上高低的差别?
2008-07-10 01:46:37
508
3
- 高通量测序技术ngs用什么仪器
2017-09-25 13:45:02
365
1
- 高通量基因测序检查出基因有问题怎么办
2015-09-04 11:15:38
367
1
- 有谁买过高通量肿瘤测序试剂盒吗?
2017-09-26 02:54:51
476
1
9月突出贡献榜
- 单位预算忏悔
- 饿啊地方
- 空中有牛
- 依然相信你会
- 本生(天津)健康科技有限公司
- 猫合宝
- 广东皓天检测仪器有限公司
- 武汉安德信检测设备有限公司
- 上海一科仪器有限公司
- futu888
- 牛牛麻麻2
- 东莞市皓天试验设备有限公司
推荐主页
最新话题
参与评论
登录后参与评论