我要发布
仪器网/ 仪器社区/ 蛋白质定量/ iTRAQ、SILAC和SWATH等相比,我更应该选择哪一种...

iTRAQ、SILAC和SWATH等相比,我更应该选择哪一种定量的方法呢?

心腹明朗    2016-10-11    蛋白质定量    浏览 249 次

精彩问答
jscuan123 发布日期:2016-10-12
目前主流的定量蛋白质组方法有5种,分别是iTRAQ、SILAC、MRM(MRMHR)、label-free和SWATH 。其中Z流行的是iTRAQ定量蛋白质组方法,该方法不依赖样本,可以做任意样本的总蛋白质的差异定量,而且定量准确,这个层次上label-free虽然也可以做任意样本,但是定量准确度难以保障。SILAC是仅仅适合细胞层次的蛋白质组定量,组织的定量需要摸索或者前人已经摸索的模式,中途测试新组织难度较大,极易失败,细胞层次的SILAC培养费用高昂,不适合做商业化。MRM和SWATH都是目标蛋白质组相关的定量模式,但是SWATH可以完成数千种蛋白的定量,准确度极高,通量远高于MRM,对于亚细胞结构、细菌、真菌、细胞分泌物等样本,SWATH效果非常好,当然,SWATH价格相对较高。SWATH本身对物种没有偏向性,也是目标蛋白定量的一种,定量结果准确,可以和MRM媲美,发文章更具有说服力,但是一次能定量只能达到2000多个蛋白
全部评论
伍祖加 发布日期:2016-10-12
我之前用SWATH定量,效果还不错,其他的两种定量没有做过,不好说
饭桶877 发布日期:2016-10-12
SILAC是仅仅适合细胞层次的蛋白质组定量,组织的定量需要摸索或者前人已经摸索的模式,中途测试新组织难度较大,极易失败,细胞层次的SILAC培养费用高昂,不适合做商业化。MRM和SWATH都是目标蛋白质组相关的定量模式,但是SWATH可以完成数千种蛋白的定量,准确度极高,通量远高于MRM,对于亚细胞结构、细菌、真菌、细胞分泌物等样本,SWATH效果非常好,
最新主题
相关版块
我要评论
X您尚未登录
账号登录
X您尚未登录
手机动态密码登录
X您尚未登录
扫码登录
官方微信

仪器网微信服务号

扫码获取最新信息


仪器网官方订阅号

扫码获取最新信息

在线客服

咨询客服

在线客服
工作日:  9:00-18:00
联系客服 企业专属客服
电话客服:  400-822-6768
工作日:  9:00-18:00
订阅商机

仪采招微信公众号

采购信息一键获取海量商机轻松掌控