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DNA 合成柱有替代品吗?

狈缚恃乃    2015-12-10    DNA合成仪    浏览 473 次

收到一份关于“Embed™ 通用 CPG Frits 合成柱"的资料,不知道具体是什么?效果怎么样?

精彩问答
xiaofeitiandg 发布日期:2015-12-11
DNA合成步骤:
diyi步----去封闭(Deblocking),用三(TCA)去除CPG所连核苷上的DMT,以暴露5’羟基,供下一步缩合。此步需要注意TCA为一较强的酸,可能会有脱嘌呤作用,故TCA与寡核苷酸接触时间不要超过规定时间。
第二步----活化(Activation),在缩合之前,单体与四唑混合并进入合成柱,此时四唑提供一个质子给3’磷酸上二异丙胺基的N原子,质子化的二异丙胺是一个良好的游离基团,与四唑形成亚磷酰胺四唑这种活性中间体。此步四唑过量保证了单体活化充分。
第三步----连接(Coupling),亚磷酰胺四唑与CPG所连的核苷酸碰撞时,与其5’羟基发生亲核反应,发生缩合并脱掉四唑,合成的寡核苷酸链延长一个。此步单体相对于CPG所连核苷酸上5’-羟基过量保证了连接的GX率。
第四步----盖帽(Capping),为了防止未反应的与CPG相连的5’羟基在随后的循环中被延长,需要在连接反应充分进行之后使之封闭,常用乙酰化来封闭此羟基。临用前混合乙酸酐和N-甲基咪唑等形成一活性很强的乙酰化试剂,与少量未参与连接反应的5’羟基缩合成酯键。由于须封闭的羟基少且乙酰化试剂活性高和充分过量,此步反应速度很快,几秒钟即足够。太长的盖帽时间有在非预期位置发生乙酰化反应的可能,且增加乙酸酐与痕量水形成酸攻击新生成的亚磷酯键的危险性。
第五步----氧化(Oxidation),连接反应后新加上的核苷酸通过亚磷酯键(磷为三价)与CPG上相连的寡核苷酸链连接,此亚磷酯键不稳定,易被酸、碱水解,因此需将此处三价磷氧化为五价的磷。常用的氧化剂为碘的四氢呋喃溶液。此步反应速度亦很快。应注意Z后一个循环时,氧化步骤不可省略。此外亦可用其他氧化剂来完成氧化,从而得到各种符合实验需要的寡核苷酸。
循环上述一至五步,寡核苷酸链即可延伸至所需长度时即可完成。
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