● 灵活的空间转录组装置
精确和可控的MERFISH/seqFISH实验的完整实验装置
● 自动化注液
能同时控制超过23个溶液的流量
● 与显微镜同步
通过TTL触发器和SDK开发包实现微流体的同步灌注和成像功能
● 高度可重复性
稳定和自动化的流体系统,实现更好的重复性。
● 节省时间和试剂
使用更少的昂贵试剂,更快的实验。
用于空间转录组学的SEQFISH包
该应用包包含ESI操作软件和OB1压力真空控制器、微流体分配阀MUX Distribution12等,可以帮助您快速进行MERFISH/seqFISH/seqFISH+实验,通过ESI操作软件实现整个实验系统的软件控制和自动化运行。
该应用包的主要优势:
● 超精确的小体积液体分配的流量控制
● 精确自动分配高达数十种染料
● 与其他设备同步如荧光显微镜
● 同时对不同样品进行成像
● 提高实验的再现性
● 不同种溶液的快速简单的顺序注入系统
● 使用灵活的操作软件实现测序和自动化实验
● 通过并行使用多个芯片或具有多个通道的微流控芯片来扩展分析
● Sequence序列器可实现各个系统平台的溶液的自动化运行
该应用包的主要特点是:
● 降低成本
● 实用,简单方便。
● 灵活多样
● 适应于每个SeqFISH实验所需要的液体试剂的数量
● 允许在微流体尺度上进行多重荧光原位杂交实验,通过减少所需试剂的体积,大大降低每次实验的成本。
Elveflow微流体实验系统平台适合长时间的实验,具有出色的稳定性,没有潜在的有害的压力峰值风险。此外,空间转录组学的SEQFISH包内的每个组件都是可调配的,以满足您的实验室基础建设需求和实验步骤需求。
为什么使用微流控进行荧光原位杂交实验?
使用微流体技术是进行MERFISH(多重误差-稳健荧光原位杂化)或seqFISH(次序荧光原位杂化)并观察多个基因及其空间构型的最有效方法,因为:
● 允许使用大量的昂贵染料和缓冲液进行实验
● 与生物学应用和显微镜观察完全兼容
● 可实现一个自动化序列,将溶液注入细胞,创建一个特定的实验装置;
● Elveflow集成微流体平台系统,使实验系统更加紧凑和易于使用;
● 可以将多个不同的芯片连接到系统平台,方便并行观察不同的样品;
在此荧光原位杂化系统装置之前,该应用包可以与其他微流体步骤相结合,例如单细胞隔离的单细胞包封[1]。
微流体也可以被应用于称为MA-FISH的方法,该方法使用稀释探针溶液的震荡流或执行条形码(DBiT - seq)。
泰初科技拥有微流体流动控制领域超过6年的应用经验,可以提供先进的流体控制、软件开发和生物学领域的专业知识,是值得信赖的合作伙伴。
[1] Mayr U., Serra D., Liberali P. Exploring single cells in space and time during tissue development, homeostasis and regeneration. Development, 2019, 146(12),
应用
seqFISH是一种高灵敏的技术,可以准确的检测出单细胞RNA-seq或免疫染色通常检测不到的低拷贝数基因。此外,在RT-PCR和RNA的测序中,逆转录或PCR扩增往往会导致定量偏差。由于seqFISH可以应用于任何组织类型而无需预先选择基因,因此,其能够不偏不倚地发现与某些生物现象相关的新基因。
● 不同的荧光原位标记方法:seq-FISH, MER-FISH, seqFISH+, HCR-FISH
● 蛋白质组学和空间组学应用
● 识别新的细胞类型
● 基因组组织成像
● 核架构图成像
● 细胞轨迹分析
● 转录物和蛋白质的亚细胞定位
● 配体-受体对分析
● 用于转录组和蛋白质组成像的超过10,000个分子
● 细胞间通讯和信号研究
● 组织微环境对细胞状态变化和发育轨迹的影响
● 复杂的多细胞生物系统分析
● 复杂生物现象的研究
● 测量单细胞在各自空间位置上的表型和基因组状态
空间转录组学的原理
seqFISH 能够精确地原位定量[1]的mRNA水平。SeqFISH 和 MERFISH 使用探针检测单细胞空间转录组[1][2][3]。
首先,用一组荧光FISH探针和标记染料进行原位杂化。然后,使用DNase去除荧光团,mRNA再次与相同的FISH探针杂化,但使用不同的标记染料。几轮杂化和其他染料允许在单细胞[4]中对几个基因进行条形编码。
SeqFISH+是改进的SeqFISH技术,非常适合细胞的空间和生物过程研究。其将seqFISH与共聚焦显微镜相结合,产生超分辨率成像,并在单细胞[5]中多路复用10,000个基因。
多重误差稳健荧光原位杂化(MERFISH)是对单分子荧光原位杂化(smFISH)的改进。该方法大规模并行并同时在空间上识别数十万中RNA。此外,由于使用了一些未分配的二进制条码,该方法可以检测错误,然后以错误鲁棒性的方式进行纠正。这是与seqFISH相比的主要区别,seqFISH以颜色序列编码[6]。
微流控芯片技术平台改进了seqFISH和MERFISH方法,降低了成本和节省了实验时间,同时提供了实验流程的自动化运行和实验可再现性[7]。
[1] Shah, Sheel & Lubeck, Eric & Zhou, Wen & Cai, Long. (2016). In Situ Transcription Profiling of Single Cells Reveals Spatial Organization of Cells in the Mouse Hippocampus. Neuron. 92. 342-357.
[2] Raj A, van Oudenaarden A. Nature, nurture, or chance: stochastic gene expression and its consequences. Cell. 2008;135:216–226.
[3] Asp, M., Bergenstråhle, J., Lundeberg, J., Spatially Resolved Transcriptomes—Next Generation Tools for Tissue Exploration. BioEssays 2020, 42, 1900221.
[4] Lubeck, E., Coskun, A., Zhiyentayev, T. et al. Single-cell in situ RNA profiling by sequential hybridization. Nat Methods 11, 360–361 (2014).
[5] Eng, CH.L., Lawson, M., Zhu, Q. et al. Transcriptome-scale super-resolved imaging in tissues by RNA seqFISH+. Nature 568, 235–239 (2019).
[6] Moffitt, J R, and X Zhuang. “RNA Imaging with Multiplexed Error-Robust Fluorescence In Situ Hybridization (MERFISH).” Methods in enzymology vol. 572 (2016): 1-49.
[7] Rodriguez-Mateos, P., Azevedo, N.F., Almeida, C. et al. FISH and chips: a review of microfluidic platforms for FISH analysis. Med Microbiol Immunol 209, 373–391 (2020).
空间转录组学的SEQFISH应用包的配置:
● OB1压力流量控制器
● 流量传感器MFS(获得更好的实验性能,可选用BFS流量计)
● 一个或两个微流体分配阀MUX Distribution12
● 导管和鲁尔接头套装
● 样品储液池,从1.5mL到100mL等
● 微流控芯片(可选,根据实验要求而定)
● ESI自动化控制软件
● 使用手册
在您的实验装置中的任何地方监控实时压力的变化本应用的目的是展示如何在您的微流体装置中的任何位置安装压力反馈的
根据Christopher和Anna[1]的说法“微流体技术提供了一种产生高度均匀的液滴和气泡的有效方法,也
引言流体包裹体是封存在矿物晶格缺陷及穴窝中的原始地质流体,常用于揭示不同时期成岩成矿物化条件、流体成分和物质
关于微流体中注射泵的响应性的介绍由于注射泵易于使用并且能够快速设置微流体实验,因此,注射泵广泛应用于微流体的
出色的性能精确、稳定、响应时间、可重复性、可靠性……一个传感器可适应大范围的液体流量范围适应液体流量范围从1
微流控实验过程中,经常需要实时的了解实验通路上的液体流量是多少以及液体流量的实时变化,以便实验人员能够及时的
流动化学(Flow Chemistry)又被称为微化学或连续流动化学,其为化学研究和发展提供了一个崭新的、高产
流动化学(Flow Chemistry)又被称为微化学或连续流动化学,其为化学研究和发展提供了一个崭新的、高产
大多数的微流控实验研究中,很多研究人员采用注射泵或蠕动泵来泵送实验溶液,因为它们操作简单且易于设置,但是注射
摘要纳米颗粒药物递送系统通过增加特定部位的药物浓度并解决小分子药物的低溶解度、低特异性和快速清除小分子药物而