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二氧化氯消毒剂是国际上公认的高效消毒灭菌剂。它可以杀灭一切微生物，包括细菌繁殖体， 细菌芽孢，真菌，分枝杆菌和病毒等，并且这些细菌不会产生抗药性。但饮用水用二氧化氯消毒后会产生亚氯酸盐等消毒副产物。水中亚氯酸盐及氯酸盐的含量多少是评价二氧化氯作为饮水消毒剂安全性的重要指标。