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分选细胞,一个都不能少
发布:贝克曼库尔特商贸(中国)有限公司浏览次数:3315当我们在分选细胞时,总是在与时间赛跑。预约的时间段,分选样本要提前准备好,又不能提前太久。仪器参数调节,方案设置都会占用预约时长。分选过程中,希望目的细胞尽快返回到培养箱继续培养。而那些等待被分选的细胞,每一个都是那么珍贵,希望全部都被分选到。
Arnold and Lannigan (2010)
在确定喷嘴直径后,为了使液滴稳定,振动频率会落在一定范围。而细胞在液滴中的分布会服从泊松分布,以下图为例,如果我们选择P=0.25,也就是每4个液滴里含有一个细胞。那么对于任何一个选定液滴,将会有78%的概率是空液滴,19%的概率是含有一个细胞。
所以,当分选速度高于一定值时,分选的efficiency会下降。也就是意味着在纯度分选模式我们所期待的一些目标细胞,会因为不满足分选条件而被丢弃。
于是,你会看到有些同学,在分选细胞时,因为目标细胞所占比例低,又怕分选efficiency低,浪费目标细胞,于是使用2000EPS左右的速度进行分选实验。
这种佛系操作,无疑会造成更长的分选等待时间,在漫长的分选后,Z开始被分选下来的细胞活性也会下降。面对这种情况,大家可以使用混合分选模式。既能满足纯度要求,又不会让目标细胞白白浪费进入废液桶,并且将分选速度维持在高速状态,缩短分选时间,提高细胞活性。
在上面的示意图中,绿色的点代表目标细胞,红色的点代表其它细胞。
01 在纯度分选模式
●如果目标细胞在分选液滴中,而非目的细胞不在分选保护带时,这个液滴会被分选至接收管。
●如果当非目标细胞进入分选保护带,含有目标细胞的液滴会因为不符合纯度模式的要求而被舍弃,进入废液桶。
02 在混合分选模式
●我们在开启纯度分选模式的同时,如果遇到非目的细胞进入分选保护带,这些目标细胞会被分选之其它接收管,而不会被丢弃到废液桶。
●实验结束,可能含有非目标细胞的接样管,根据实际纯度可以决定是,直接使用还是二次分选。
案例分享
CytoFLEX SRT 高速分选高纯度细胞群
如前所述,相对于液滴形成速率,分选速度较高则分选效率较低(即排除率较高)。在这部分中,我们利用混合分选模式从一路液流中分选出高纯度细胞群,并将该液流和其他分选液流的排除事件输送到另一路液流。通过这种方式,排除事件可用于其他实验,而不是当废液处理。
图1显示未分选样品染色情况。
图1. 记忆T细胞分选前样品分析。冻干人淋巴细胞CYTO-COMP细胞试剂盒(产品编号6607023)溶解后按照使用说明使用DURAClone IM T细胞亚群(产品编号B53328)染色,并在CytoFLEX SRT细胞分选仪上采集数据。使用CytExpert SRT软件绘制区域。显示所有区域的细胞群统计结果,以便与分选后细胞群进行比较。
下面显示从图7所示样品分选CD4记忆T亚群的情况。三个目标细胞群均使用纯度模式分选,排除事件输送到分选液流R2,见图2。
图2. 纯度模式分选事件和被捕获排除事件的管分选统计数据。管分选窗口显示四路分选液流的设置,目标细胞从图7所示样品中圈选。L2、L1和R1位置设为纯度模式,R2用于捕获其他三路液流的排除事件。
四路液流中只要有一路未使用,就可以将任何一路或所有其他液流的排除液滴输送到该路液流,从而实现目标细胞群无损失分选。
图3显示排除液流的分选后分析。示图涵盖所有选定事件以及导致排除的污染物。
图3. 纯度模式分选事件和被捕获排除事件的管分选统计数据。管分选窗口显示四路分选液流的设置,目标细胞从图7所示样品中圈选。L2、L1和R1位置设为纯度模式,R2用于捕获其他三路液流的排除事件。
成功小窍门
●分选需要掌握速度、得率和纯度之间的平衡。一般情况下,上述三项指标只可以优先考虑其中两项,余下一项必受影响。
●如果出现导致大多数排除事件的污染细胞群,排除液流对故障排查很有帮助。重新分析排除液流还可以发现设门策略中的缺陷。
●排除法还可以保留感兴趣的细胞群,即便细胞群已受污染,保留的样品重新分选,获得更高的纯度。
●请记住,可以将数路排除液流合并成一路液流,或将其分离为单独的排除液流。
●富集模式分选的事件不存在排除事件。
2021-10-18相关仪器 -
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