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颠覆认知,“质”的飞跃 – Orbitrap Astral高分辨质谱仪年度论文汇总
发布:赛默飞色谱与质谱中国浏览次数:20关注我们,更多干货和惊喜好礼
Orbitrap Astral?高分辨质谱仪发布一年以来,在全球引起轰动,被很多组学研究工作者所青睐,行业内专家惊呼“一款产品改变一个研究领域格局”,在质谱产品发展如此多年来,实属罕见。短短一年,共发表了超过44篇SCI论文,超过以往质谱产品发布的10倍,真正成为科研神器。
当然我们也梳理了发表文章研究领域,我们也惊奇的发现Astral不仅在传统组学领域,包括疾病研究,翻译后修饰研究,单细胞研究,空间蛋白质组学研究,疫苗开发,溶酶体研究,母乳研究等都有所突破。“想之前所不敢想,做之前所不敢做”,真正突破研究壁垒。
下面就让我们走进几位学者发表文章,让我们看看Astral如何帮助研究者突破研究壁垒。
(点击查看大图)
实验室利用Nanomate直喷雾接口对于蛋白酶解样本直接上样,我们能够在1分钟内使用200 ng细胞酶解肽段作为起始材料,在Orbitrap Astral上自信地鉴定出>1300个蛋白质。
将方法进一步优化,在20s内鉴定>85%的蛋白质,并且重复多次上样,同样稳定获得。
应用优化的策略使用Orbitrap Astral 对neat plasma样本进行了蛋白质组深度评估,并成功在1分钟的LC-MS/MS中使用窄窗口数据无关采集(nDIA)鉴定出>180个蛋白质,其中与FDA认证的biomarker超过30多个。
(点击查看大图)
使用了细胞周期细胞HEK293以及原发性急性髓系白血病 Acute Myeloid Leukemia,(AML) 培养模型,来验证Orbitrap Astral高分辨质谱仪仪器在单细胞蛋白质组学检测上的表现。
HeLa肽段,从鉴定结果来看,Orbitrap Astral高分辨质谱仪在保持高质量数据的前提下(大多数蛋白的cv值均小于20%),与Orbitrap Eclipse相比,其蛋白鉴定数增加了一倍。
测试来源相似的高度相似细胞的细胞异质性的能力,对从4个群体中分别获得的54个AML模型细胞进行检测,在细胞群中鉴定到了3892个蛋白,每个细胞平均鉴定出超过2000个蛋白。对Orbitrap Astral高分辨质谱仪鉴定到的蛋白进行分析,很大一部分都是中低端丰度的蛋白,其中所鉴定到的转录因子增加了接近8倍,激酶数量增加了2倍。
这些数据说明Orbitrap Astral高分辨质谱仪在单细胞水平检测能力的增加对于提升我们的生物学认知起到了关键的作用。
在细胞的异质性检测中,数据可以清晰地展现白血病模型中的表型多样性,蛋白在细胞不同的分化阶段表现出异质性的表达模式,这说明单细胞蛋白质组学的数据捕获到了非单细胞数据可能会遗漏的蛋白在不同细胞阶段的渐进变化。
Orbitrap Astral高分辨质谱仪特点
提供创纪录的快速通量性能,每年可以分析数以万计的样本,8 分钟高达 8000+ 的蛋白质鉴定
蛋白组学更深层次覆盖率,1 小时鉴定 12000+蛋白质
更高灵敏度,每天分析60个单细胞,每个单细胞超过6000+个蛋白质鉴定
更精准的定量,能够提供极高的可重复性测量鉴定蛋白质的 CV 值在 4%~5% 之间
当然我们收集了目前Orbitrap Astral发表文章列表,如果感兴趣,请扫描以下二维码获取论文汇总文件。
如需合作转载本文,请文末留言。
2024-07-11相关仪器 -
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