SCION Artemis 6000 采用的树脂柱是一种特殊的离子交换材料，与每种氨基酸有不同反应，因而不同的氨基酸有不同的分离时间。进样器从样品瓶中吸入指定体积的样品（经过前处理的样品），并将样品传送到分离柱中。样品中的氨基酸吸附在分离柱的树脂上，当不同的缓冲液在输液单元的传输下进入分离柱时，因溶液的PH值、离子强度、分离柱温度以及各种氨基酸本身的性质不同而使各种氨基酸得以分离，分离后的氨基酸与试剂泵传输过来的茚三酮试剂在高温反应器中发生衍生反应，生成可以被分光光度计检测的有色物质，仪器通过精确控制各种分离条件以保证分离、检测的重复性，对比标准样品即可对未知样品中的氨基酸进行定性定量检测。