仪器分类: | 第二代 |
将您的单细胞工作流程自动化
一、仪器简介
单细胞测序仪器设备Chromium Connect,是一款全自动的单细胞建库解码系统。可自动化完成从单细胞悬液到可用于测序的文库制备,从而实现工作效率的提升,可以专注于更重要的工作。简化后的工作流程将单细胞分离和条形码与文库制备相结合,将手动操作时间从8小时以上缩短到1小时之内。同时,自动化工作流程减少了手动移液带来的误差,实现了流程标准化,可以产生一致且可重复的单细胞数据。结合Cell Ranger数据分析软件和Loupe Browser可视化软件,轻松实现单细胞水平转录组、免疫分析、基因组拷贝数变异和染色质开放性等研究。品牌10x Genomics,型号Chromium,产地新加坡,代理商是斑马鱼(北京)科技有限公司。
二、工作流程
单细胞测序流程是从单细胞或细胞核悬液开始的。采用先进的微流体技术生成含有单细胞或细胞核的微滴。接着按照简化的流程来构建文库。测序后采用整合的数据分析流程和可视化软件来处理和分析数据。
三、让您的效率提升10x
Chromium Connect将您的单细胞测序流程自动化,包括基因表达和细胞表面蛋白的分析,让您可以轻松地从细胞直接生成立即可测序的文库。对于不同的实验和不同的用户,该仪器都能够产生一致且可重复的单细胞基因表达结果。能够减少手动移液的失误,将您的手动操作时间从8小时以上缩短到1小时以内。这个全面整合且经过验证的解决方案将帮助您充分利用时间,充满信心地开展单细胞实验。
四、技术原理
Chromium单细胞解决方案能够从多个角度捕获细胞活性的分子读数,包括基因表达、染色质可接近性、细胞表面蛋白、免疫克隆型、抗原特异性以及CRISPR编辑。这项技术的核心之处在于能够产生成千上万个单细胞微滴,而每个微滴都含有一个可识别的条形码,便于下游分析。
Next GEM技术
①每个Chromium解决方案都从高度多样化的凝胶珠(GelBeads)开始,每个凝胶珠都带有独特的寡核苷酸条形码标签序列,以及便于捕获目标分子的功能化序列。
②在Chromium系统内,将带有条形码标签的凝胶珠与细胞或细胞核、酶以及分液油混合,产生成千上万个单细胞乳液微滴,这些微滴被称为“GEM”(Gel Bead-in-emulsion)。
③每个GEM都作为单独的反应微滴,凝胶珠在其中溶解,捕获每个细胞的目标分子,添加条形码并扩增。
④添加条形码后,来自同一细胞或细胞核的所有片段都共享一种10x 条形码。将成千上万个细胞的带有条形码的产物混合,进行下游反应,从而产生与短读长测序仪兼容的文库。
⑤在测序后,全方位的生物信息学工具将利用可识别的条形码序列将测序片段定位到原本的单细胞或细胞核。
五、一台自动化系统,多种单细胞分析
高效分析成千上万个细胞,通过不同的工作流程揭示细胞异质性。一系列单细胞测序分析可选择连续流程,也可选择灵活的模块化流程,以适应您的日常操作。
1. 单细胞基因表达:将您的3’单细胞基因表达工作流程自动化,让您更高效地探索细胞异质性,发现新的靶点和生物标志物,并阐明复杂的细胞进程。
2.、单细胞免疫分析:将您的5’基因表达和V(D)J扩增流程自动化,并可选择采用Feature Barcode技术同时测定细胞表面蛋白表达和抗原特异性,以便大规模分析免疫系统的细胞异质性,以及T细胞和B细胞受体多样性。
3.也可使用单细胞基因表达与细胞表面蛋白同时分析的5’多组学免疫分析的自动化工作流程。
4. 技术培训和支持:Xenium、Visium CytAssist、Chromium Controller,Chromium X、Chromium™ Next GEM Single Cell 3' GEM, Library & Gel Bead Kit、Visium Spatial for FFPE Gene Expression Kit、Chip G、Feature Barcode Library Kit……斑马鱼(北京)科技有限公司是10x Genomics代理商,负责销售仪器和试剂,具备丰富的单细胞测序和空间转录组实验方面经验,可为用户提供单细胞悬液制备,建库,测序,生信分析等一整套解决方案。在购买仪器后,将安排有资质的工程师进行现场安装和培训。培训内容包括样本制备、仪器操作、数据分析。在培训完成后,客户还将获得全方位支持,包括远程技术支持(Technical Support)、现场应用科学家(FAS)、现场服务工程师(FSE)和生物信息学应用(Applied Bioinformatics)团队,覆盖实验工作流程、试剂耗材、仪器和软件的各个方面。
六、单细胞分离、标记和文库制备集成于一台经过优化的仪器中
集成了专为单细胞流程而定制的组件、自动化专属的试剂和耗材,以及轻松易用的触摸屏计算机。从直观的自行设置到防出错的试剂上样,即便您是新手,也能让您快速启动单细胞测序实验。
七、仪器技术参数:
1、功能用途:利用微流控芯片对单细胞悬液样本进行精确分区并建立油包水反应体系,每个反应体系含有特定标签序列,对样品中的数千个单细胞mRNA进行建库,通过对文库的测序分析,解读细胞群体的基因表达谱。可自动化完成从单细胞悬液到可用于测序的文库制备,减少了手动操作误差,实现了流程标准化,可以产生一致且可重复的单细胞数据。
2、处理样本类型:一种微流体芯片兼容不同大小及不同类型的真核细胞;
3、简单的实验操作流程:从单细胞悬液到测序文库的生成在8小时内可以完成;
4、样本处理通量:仪器可同时运行1-8个通道,每次运行最多可产生8,0000个单细胞的转录本;
5、分区与标签数:每次运行产生>8万个纳升级分区,含有75万个独特的序列标签(每个标签由16个碱基构成);
6、集成工作流程中的步骤,从单细胞partitioning和barcoding到测序文库生成一站式完成;
7、配备自动化工作流程,易于使用的触摸屏计算机,简易的操作方式;
8、通过减少用户操作之间的差异,获得一致的单细胞基因表达结果;
9、从单细胞悬液到测序文库全自动化生成不超过9小时;
10、手动操作时间≤1小时;
11、配备热循环模块,能自动实现PCR反应;
12、配备磁力装置,自动完成清洗工作;
13、配备2D条形码扫描器,扫描试剂信息并跟踪试剂使用情况;
14、可以调节高度和角度,适合各种类型用户;
15、软件包括:免费安装,免费升级;
八、斑马鱼(北京)科技有限公司,是10x Genomics公司的官方授权经销商,负责产品的推广销售和技术支持,为您提供技术参数,报价、选型、实验指导、安装培训、售后服务等,更多信息可留言或来电咨询。