PCR相关的问题
-
请各位朋友们帮我分析下 我以前PCR扩增一个基因的CDS,长度1200bp左右,梯度摸好温度Z佳为50度,然后我扩增了20个样本,结果都很好,全部送出去双向测序,序列blast也对了,峰图也挺好的,可是现在再用同一条件就是扩增不出来了,重新摸了温度也解决不了问... 请各位朋友们帮我分析下 我以前PCR扩增一个基因的CDS,长度1200bp左右,梯度摸好温度Z佳为50度,然后我扩增了20个样本,结果都很好,全部送出去双向测序,序列blast也对了,峰图也挺好的,可是现在再用同一条件就是扩增不出来了,重新摸了温度也解决不了问题,体系也进行了优化,dNTP,引物,模板的用量我都进行正交优化了,还是没用。很巧妙的是在一次摸条件(混合模板)的时候56度跑出来了,而且非常亮,紧接着同样条件然后扩增一批,结果目的条带什么都没有,真的不解,稳定咋这么差,我这批模板做了10来个其他基因都是一次就能跑出来,测序结果都很好,模板没问题,这个基因的CDS引物我又重新合成了一次还是不行,所用的酶都试了好几种,MIX也用了,都无济于事。你们觉得我是重新设计引物还是咋的?但是这对引物跑的前面我20个测序结果都出来了,所以不想再换了,真的恼火,请大虾们帮帮小弟 万分感谢 展开
全部评论(3条)
-
- 墩烙肇偈鹤坝 2010-08-12 00:00:00
- 估计是你的PCR仪不稳定!
-
赞(4)
回复(0)
-
- caobaolai1962 2010-08-11 00:00:00
- 我觉得Z直接了当的方法还是换引物,这个primer就是不行 如果你还想再继续试的话,可以试试看touch down PCR 从56度逐渐减低到50度 或者用没有扩出来的diyi轮产物再做一轮PCR,像nested PCR一样
-
赞(11)
回复(0)
-
- 小啦啦gg 2010-08-12 00:00:00
- 我觉得根据你说的,就有一种可能啊,就是你的模板降解了。这个基因比较难扩增,所以对模板的要求比较高。引物应该很少降解,而且你以前也做出来了。 我建议你除了引物和模板全部换成你们隔壁实验室的试剂,连pcr仪Z好也用别人的试试,因为什么都有可能坏,而且你trouble shooting的时候没有做positive control,怎么知道不是你的dNTP或者polymerase坏了,所以之后的实验一定要做positive control。如果还不行,重新制备模板,引物一般没有问题,祝你成功 好吧,照你说的,每个环节都没有问题了,那估计是引物的问题了,但是我没有碰到过这样的情况,所以没有感性认识啊,照常理说,什么东西都一样,出来的结果不同,想不通。。。
-
赞(16)
回复(0)
热门问答
- PCR相关的问题
- 请各位朋友们帮我分析下 我以前PCR扩增一个基因的CDS,长度1200bp左右,梯度摸好温度Z佳为50度,然后我扩增了20个样本,结果都很好,全部送出去双向测序,序列blast也对了,峰图也挺好的,可是现在再用同一条件就是扩增不出来了,重新摸了温度也解决不了问... 请各位朋友们帮我分析下 我以前PCR扩增一个基因的CDS,长度1200bp左右,梯度摸好温度Z佳为50度,然后我扩增了20个样本,结果都很好,全部送出去双向测序,序列blast也对了,峰图也挺好的,可是现在再用同一条件就是扩增不出来了,重新摸了温度也解决不了问题,体系也进行了优化,dNTP,引物,模板的用量我都进行正交优化了,还是没用。很巧妙的是在一次摸条件(混合模板)的时候56度跑出来了,而且非常亮,紧接着同样条件然后扩增一批,结果目的条带什么都没有,真的不解,稳定咋这么差,我这批模板做了10来个其他基因都是一次就能跑出来,测序结果都很好,模板没问题,这个基因的CDS引物我又重新合成了一次还是不行,所用的酶都试了好几种,MIX也用了,都无济于事。你们觉得我是重新设计引物还是咋的?但是这对引物跑的前面我20个测序结果都出来了,所以不想再换了,真的恼火,请大虾们帮帮小弟 万分感谢 展开
- 离子交换柱相关问题
- 离子交换柱在吸附过程中,通常是从柱子上面进料,这样由于长时间的压力和流速等原因,会导致树脂颗粒间接触的很紧密,减少了颗粒的表面积,从而影响树脂的离子交换量。 那么可不可以从柱子的下面进料呢?个人觉得这样可以解决上述问题。 另外,离子交换柱... 离子交换柱在吸附过程中,通常是从柱子上面进料,这样由于长时间的压力和流速等原因,会导致树脂颗粒间接触的很紧密,减少了颗粒的表面积,从而影响树脂的离子交换量。 那么可不可以从柱子的下面进料呢?个人觉得这样可以解决上述问题。 另外,离子交换柱在反洗过程中,反洗水已经没有任何肉眼可见杂质后,降液面继续反洗,反洗水又会变的很浑浊,这是什么原因呢? 展开
- 关于五味子的相关问题!!!
- 问题一:五味子有什么功效,都能用它做什么?问题二:五味子一般都销售到那里?价格怎么样?它的市场前景怎么样?问题三:五味子出口的话应该怎么操作?到那里可以找到国外采购商?... 问题一:五味子有什么功效,都能用它做什么? 问题二:五味子一般都销售到那里?价格怎么样?它的市场前景怎么样? 问题三:五味子出口的话应该怎么操作?到那里可以找到国外采购商? 展开
- 与“夜视仪”相关的问题
- 一介绍一下目前市面上夜视仪的分类工作原理二夜视范围50米以上(可达百米Z好了)夜视仪的各项参数(如:穿透性能)及市场价格——此项期待ZD作答三购买途径——可略... 一 介绍一下目前市面上夜视仪的分类 工作原理 二 夜视范围50米以上(可达百米Z好了)夜视仪的各项参数(如:穿透性能)及市场价格 —— 此项期待ZD作答 三 购买途径 —— 可略 展开
- 机器人电源系统的相关问题
- 您好,我想向您咨询一下目前机器人的电源系统的一些情况。所有的机器人都是有电池的吗??如果是使用电池供电的话是用哪种电池呢??希望能够得到您的帮助,谢谢,如果您看到我的提问,可以拨打13541130822回复,免贵姓李,或者加QQ1045734015
- 离子色谱仪相关问题集锦
一、压力问题
1、系统压力增大:
#判断方法:
①保持泵开的状态,把保护柱的进液口拧开,看一下压力,正常情况下,1.5mL/min流速压力为0或零点几MPa;
②保持泵开的状态,将保护柱的进液口拧上(保证不漏液),将保护柱出液口拧开,看一下压力,正常情况下,1.5mL/min流速压力≤3MPa;——这一步是测试单独保护柱的压力;
③保持泵开的状态,将保护柱的出液口拧上(保证不漏液),将色谱柱出液口拧开,看一下压力;——这一步是测试保护柱和色谱柱的压力;
④保持泵开的状态,将色谱柱出液口拧上,YZ器的淋洗液出口拧开,回流进口和出口都拧开,看一下压力,正常情况下,1.5mL/min流速压力较之前增大值应≤0.4MPa;
⑤然后分别连接YZ器的淋洗液出口→回流进口→回流出口,分别看一下压力。
1a:保护柱压力高
1a-1:清洗或更换筛板:将保护柱取下并拧下柱头,用镊子小心把筛板取下,放入无水乙醇中浸泡并超声清洗10-15min,去离子水冲洗后装上,或者直接更换新的筛板。(筛板图片见图1)
图1
1a-2:清洗保护柱:将保护柱反接后用10倍浓度的淋洗液,0.3 mL/min低流速冲洗,再用正常淋洗液浓度冲洗,然后正接。
1b:色谱柱压力高
1b-1:清洗或更换筛板:将色谱柱取下并拧下柱头,用镊子小心把筛板取下,放入无水乙醇中浸泡并超声清洗10-15min,去离子水冲洗后装上,或者直接更换新的筛板。
1b-2:清洗色谱柱:将色谱柱反接后用10倍浓度的淋洗液,0.3 mL/min低流速冲洗,再用正常淋洗液浓度冲洗,然后正接。
1c:流速设定过高:按照色谱柱分析报告设置流速。
1d:流动相使用不当或有缓冲盐析出:使用优级纯试剂。
1e:进样阀损坏或堵塞:含有固体颗粒的样品堵塞阀体造成压力升高,样品要经过针头过滤器过滤才能进样。
2、压力波动:
2a:流动相气泡干扰:流动相要经过脱气处理。
2b:单向阀处有气泡:开泵,逆时针拧松排气阀,用注射器抽气,待抽出液体之后拔下注射器,观察流出的液体比较均匀,再将泵排气阀拧紧。步骤如图2/3/4
图2
图3
图4
2c:单向阀被污染或者损坏:清洗或更换单向阀。
2d:柱塞杆和密封圈磨损漏液:更换柱塞杆和高、低压密封圈,见图5。
图5
3、压力降低:
3a:流动相气泡干扰:流动相要经过脱气处理。
3b:系统漏液:处理方法见二
3c:流速设定过低:按照色谱柱分析报告设置流速。
3d:柱温过高:按照色谱柱分析报告设置柱温。
4、压力为0:
4a:系统漏液:处理方法见二
4b:泵不吸液:
4b-1:滤头堵塞:察看滤头颜色是否改变,一般情况下污染物会使滤头变色;将滤头取下,用洗耳球吹吸滤头,看气流是否通畅,滤头图片见图6。
处理:将滤头取下放入50mL烧杯中,加入1:1 HNO3或95%乙醇至没过滤头,将烧杯放入超声波清洗器中清洗30min,清洗完确定无问题后,须将滤头用去离子水洗净至中性再安装到流路上。
图6
4b-2:输液泵进液管排除空气
将泵进液管接头拧下,用注射器或洗耳球将管路吸满液体,将水瓶抬高,在管路出液均匀状态下将泵进液管连接到泵上拧紧。
注意:拧接头的是宜松不宜紧,以不漏液为宜。太松容易漏液,太紧会造成管路卡死而不流液或系统压力,造成超压。
4b-3:单向阀处有气泡
开泵,逆时针拧松排气阀,用注射器抽气,待抽出液体之后拔下注射器,观察流出液比较均匀,再将泵排气阀拧紧。
4b-4:单向阀堵塞
取出两个单向阀,放入50mL烧杯中,加入无水乙醇盖过单向阀,放入超声波清洗30min,然后按照1:1的比例加入10%的HNO3(用无水乙醇稀释),清洗5min后,用去离子水将单向阀冲洗干净,重新安装到泵中。(注意单向阀是有方向的,在单向阀中有一个小圈圈,离小圈圈近的一端为液体的入口,如果忘记顺序,可以用洗耳球吹气判断单向阀方向)
4c:保护柱、色谱柱故障:更换保护柱或色谱柱
4d:保险丝断或电源问题:更换保险丝
4e:柱塞杆折断:更换泵的柱塞杆
4f:压力传感器损坏(流动相流动正常,但无压力):更换压力传感器
二、漏液情况
1:接头处漏液
1a:接头处有卡痕松动:切掉PEEK接头的前段变形部分
1b:接头磨损:更换新的接头
2:泵漏液
2a:泵的后冲洗漏液:更换泵的柱塞杆和高、低压密封圈
2b:排气阀漏液:重新拧紧或更换排气阀的密封圈
3:检测器漏液
3a:接头漏液:重新拧紧
3b:侧边漏液:更换新的检测器,同时测试YZ器的压力
三、背景电导高
1、淋洗液基体中有高电导的物质
如水处理不纯或所用的药品不纯,含有其他盐类,经过YZ器YZ后变为相应的高电导值的酸,使电导值居高不下,解决方法:将水重新处理并更换淋洗液。
2、YZ器损坏,无法起到YZ背景电导的作用
更换新的YZ器。
3、电导池中结晶有固体电解质
将电导池取下,滴加一滴1:1的硝酸,再用去离子水冲洗干净。
四、保留时间的变化
1、柱温变化:按照色谱柱分析报告设置柱温
2、流动相组分变化:按照色谱柱分析报告配置淋洗液
3、色谱柱没有平衡:通淋洗液待仪器稳定,约40min
4、流速变化:按照色谱柱分析报告配置流速
5、泵中有气泡:①流动相使用之前要经过脱气处理;② 开泵,逆时针拧松排气阀,用注射器抽气。待抽出液体之后拔下注射器,观察流出液比较均匀,再将泵排气阀拧紧。
五、基线问题
1、基线漂移
1a:温度波动
1b:流动相不均匀(脱气,使用纯度更高的试剂)
1c:电导池被污染或有气泡
1d:流动相配比不当或流速变化
1e:柱子平衡(约30-60min)
1f:流动相污染,变质或由低品质试剂配成
1g:样品中有强保留的物质以馒头样峰被洗出
2、规律的基线噪声
2a:YZ器故障
2b:有地方漏液
2c:流动相、泵、检测器中有气泡
2d:流动相混和不均匀
2e:温度影响(环境温度波动太大)
2f:其他电子设备的影响
3、不规律的基线噪声
3a:流动相污染、变质或由低质溶剂配成
3b:有地方漏液
3c:流动相各溶剂不相溶或混和不均匀
3d:电导池污染
3e:电导池内有毛刺
3f:系统内有气泡
3g:用电导模拟器替代电导检测器,采集基线噪声,若基线噪声大于10,表明电路故障,需要更换电路板。
六、峰形异常
1、鬼峰
1a:进样阀残余峰
1b:样品中未知物
1c:柱未平衡
1d:水污染
2、峰变形
2a:样品过载
2b:样品溶剂选择不当
3、前沿峰、拖尾峰
3a:柱塞板堵塞
3b:色谱柱塌陷
3c:柱外效应
3d:干扰峰
3e:平衡不足或不合适
3f:重金属污染
3g:样品溶剂选择不当
3h:样品过载
3g:柱温过低
4、分叉峰
4a:保护柱或分析柱污染
4b:样品溶剂不溶于流动相
5、峰展宽
5a:进样体积过大
5b:流动相粘度过高
5c:检测池体积过大
5d:保留时间过长
5e:柱外体积过大
5f:样品过载
- 汽车测速仪相关问题
- 图甲为GA巡逻车在高速公路上用超声波测速仪监测车速的示意图,巡逻车顶上装有测速仪,测速仪发出并接受超声波脉冲信号,根据发出和接收的信号间的时间差,测出被测车的速度,图乙中p1、p2是测速仪发出的超声波信号,n1、n2分别是p1、p2由被测车反射回来的信... 图甲为GA巡逻车在高速公路上用超声波测速仪监测车速的示意图,巡逻车顶上装有测速仪,测速仪发出并接受超声波脉冲信号,根据发出和接收的信号间的时间差,测出被测车的速度,图乙中p1、p2是测速仪发出的超声波信号,n1、n2分别是p1、p2由被测车反射回来的信号,设测速仪匀速扫描,p1、p2之间的时间间隔Dt=1.0 s,超声波在空气中传播的速度是v=340 m / s,若巡逻车和对面来的被测车相向匀速行驶,巡逻车的车速为20 m / s,则根据图乙可知,被测车在接收到p1、p2两个信号之间的时间内前进的距离是_____m,被测车的速度大小是______m / s。 求解详细的解答过程。 答案是34.1 m ,40.5m/s 展开
- pcr,cDNA引物的问题
- 用真核细胞mRNA反转录出来的cDNA来做引物进行pcr扩增,模板DNA是什么呢? 如果是真核细胞中提取的DNA,那不也是有内含子的么?那我怎么来得到目的基因呢?
- 求助:关于PCR的问题
- 在完成质粒PUC19的PCR后 ,经电泳 发现条带超过了MARKER的BP范围,现在想用一些酶把质粒切割下(我也不知道该切割引物还是质粒,感觉应该切质粒,引物切了觉得没法进行PCR了),但是我不知道应该买怎样的酶来切,希望高手帮忙解决下啊
- 气相色谱内标法检测的相关问题
- 接触GC内标法没多久,对内标法的一些问题有些疑问 :-D,主要是一些规范性的问题,如下: 1、建立方法时,计算得到的相对校正因子要满足什么要求才可以使用?有哪些资料或标准是介绍这个的吗? 2、方法更新:相对校正因子一般是多久更新一次的;或者检测过程... 接触GC内标法没多久,对内标法的一些问题有些疑问 :-D,主要是一些规范性的问题,如下: 1、建立方法时,计算得到的相对校正因子要满足什么要求才可以使用?有哪些资料或标准是介绍这个的吗? 2、方法更新:相对校正因子一般是多久更新一次的;或者检测过程中,怎样验证校正因子是否可用,要满足什么条件,RSD? 3、配制的混合标液【溶剂丙酮+农药+内标物】一般用什么容器保存,保存环境,保存期限。(麻烦这个能说详细些,对这个问题好模糊。。) 4、添加内标物的方式,是直接称量添加呢,还是称量后配成溶液后再填加??两种添加方式的标准都有。。有点纠结 以上求帮助,,要是能有相关的标准号或资料就Z好了! 展开
- 请教催化剂焙烧的相关问题
- 关于臭氧发生器性能参数的相关问题?
- 请臭氧发生器相关厂家或经销商或专家回答以下三个问题, 谢谢! 1. 对于一台臭氧发生器,其臭氧产量是固定的还是可调的,即一台产量为100g/h的臭氧发生器,其产量是始终固定在100g/h,还是可以在一定范围内变动如0-100g/h或50-100g/h。 2. 对于一台臭氧发生... 请臭氧发生器相关厂家或经销商或专家回答以下三个问题, 谢谢! 1. 对于一台臭氧发生器,其臭氧产量是固定的还是可调的,即一台产量为100g/h的臭氧发生器,其产量是始终固定在100g/h,还是可以在一定范围内变动如0-100g/h或50-100g/h。 2. 对于一台臭氧发生器,在其臭氧产量固定的情况下,其出口臭氧浓度和出口混合气体流量是否可改变,即一台产量为100g/h的臭氧发生器,其设定出口臭氧浓度为200mg/L和出口混合气体流量为0.5m3/h,可否在产量为100g/h的情况下,调节出口混合气体流量为1m3/h和出口臭氧浓度为100mg/L。 3. 对于臭氧产量可变的情况,是通过改变混合气体流量还是通过改变出口臭氧浓度来改变臭氧产量。 展开
- 高中生物PCR基因扩增问题
- 采用PCR扩增基因,n次循环之后,只含目的基因的片段占所有扩增产物的比例为?答案给的解析是这样的。请问解析中不等长片段是什么意思?麻烦了!
- 物理化学中表面张力相关问题
- 在一根平放的玻璃毛细管中装有液体,如果在毛细管右端加热,液体将如何移动?(液体为1.水 2.水银)
- 上海微电子考研相关问题
- 想考上大或者华师大的研究生希望有知道的能回答一下考试的课程还有哪些导师好些... 想考上大或者华师大的研究生 希望有知道的能回答一下 考试的课程还有哪些导师好些 展开
- 秋山八色印刷机相关问题
- 想问一下关于那个秋山八色机的电子双张检测器的问题,注意的电子不是机械的,问一下怎么调节的... 想问一下关于那个秋山八色机的电子双张检测器的问题,注意的电子不是机械的,问一下怎么调节的 展开
- 白细胞计数持续偏高的相关问题
- 患者信息:男24岁山西太原病情描述(发病时间、主要症状等):去年七月末在一次体检中发现白细胞计数偏高,但身体无任何疾病症状,在县人民医院做穿刺,医生说可能是CML,要我进一步... 患者信息:男 24岁 山西 太原 病情描述(发病时间、主要症状等): 去年七月末在一次体检中发现白细胞计数偏高,但身体无任何疾病症状,在县人民医院做穿刺,医生说可能是CML,要我进一步接受检查,但父母决定带我去山西医科大学diyi医院做检查,检查持续了近两个月,基因融合阳性,染色体阴性,象值我忘记了。白细胞计数在20~30之间。但医生还要我检查,我问医生究竟是什么情况,他们的回答总是很含糊。后来我失去耐性,中断检查。前几天,我又去做血常规化验,化验值达到111.7,医生建议我去一个血液研究所去检查,但我不知道该怎么办,身体无任何不适,B超显示脾正常,特向专业人士求助,白细胞计数持续对我会有什么影响? 想得到怎样的帮助: 希望得到Z好的建议 展开
- 关于水泵浮球的相关问题
- 1、我想知道,有没有不用浮球控制水位的其它方法? 2、一般浮球使用的寿命是多久?(铜的)价位大概在200元左右的。 3、浮球失去了控制水位的作用,是什么原因造成的?如果进行修理,可以继续使用吗? 4、一般浮球装在水箱的什么位子或具体什么样的高度算是... 1、我想知道,有没有不用浮球控制水位的其它方法? 2、一般浮球使用的寿命是多久?(铜的)价位大概在200元左右的。 3、浮球失去了控制水位的作用,是什么原因造成的?如果进行修理,可以继续使用吗? 4、一般浮球装在水箱的什么位子或具体什么样的高度算是合理或者是正确的? 5、选择什么样的浮球(例如从质量上讲)可以长时间使用? 展开
- 频谱分析仪和FFT信号分析仪的相关问题
- 我应该用频谱分析仪去测某喇叭在单一频率声源输入下,是否会产生高次谐波;但是我没有频谱分析仪,有FFT信号分析仪,我今天研究半天,哪位高手帮帮忙,可以用后者代替前者来进行实验吗...尽量详细一点,真的很急,谢谢啦
参与评论
登录后参与评论