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wgcna分析中怎样把同一模块的基因显示出来

wangyueli0929 2017-03-09 02:22:20 398  浏览
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全部评论(1条)

  • 盼╃字JUN团 2017-03-10 00:00:00
    WGCNA(Weighted Correlation Network analysis)是一个基于基因表达网络权重构建,描述基因表达的关联模式的R包。一般来说需要两个文件,多个样本的基因表达量(fpkm矩阵),可以根据表达量可以计算相关性,还有一个就是所谓的权重,简单的解释就是这些样本中的一些性状或者条件,比如重量、高度、应激条件等等,Z后的分析相当于把基因表达与条件结合起来分析两者之间的关联性或相关性。

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