银染后可以做质谱吗?
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我做sds双向电泳后,使用银染染色,染色完了以后可以做质谱吗?或者需要什么特定的方法采可以银染后再质谱?... 我做sds双向电泳后,使用银染染色,染色完了以后可以做质谱吗?或者需要什么特定的方法采可以银染后再质谱? 展开
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【本文为乐枫RephiLe公司原创文章,转载请注明,违者必究。】
摘要:上海乐枫市场部在本文中为用户提供了SDS-PAGE银染实验的基本步骤以及相关纯水应用方案。通过阐述水中杂质对银染实验带来的影响,详细解释了为什么银染实验应该中应该使用EDI纯水。
SDS聚丙烯酰胺凝胶染色是蛋白质研究的一个基础方法。染色方法有很多,实际应用中,考马斯亮蓝染色(考染)和银染是运用的Z多的方法。
考马斯亮蓝G250在游离状态下呈红色,它与蛋白质结合后变为蓝色,结合物在595 nm波长下有Z大光吸收。其光吸收值与蛋白质含量成正比,因此可用于蛋白质的定量测定。
银染实验中,在碱性条件下,银离子被还原成金属银,沉淀在蛋白质的表面上显色。蛋白电泳后的 SDS-聚丙烯酰胺凝胶在甲醇溶液中浸泡后,水洗后用硝酸银溶液银染,再水洗后用碳酸钠甲醇水溶液显色。
与考染相比,银染具有灵敏度高的优点,很多做环境、植物、育种等方面的客户,都会做银染方面的实验。银染对于试剂的要求比较高,尤其对其中使用纯水的水质要求比较高。上海乐枫(RephiLe)技术人员根据自身经验以及相关文献中的方法为用户提出以下银染实验方案:
一、仪器和试剂
乙酸(1%),显影液(2.5%碳酸钠和0.02%甲醛水溶液),乙醇(30%),固定液(乙醇:冰醋酸:水(30:10:60)),硝酸银溶液(0.1%),显影液(将溶液A在850 mL去离子水中加入37 g NaCl和37 g CuSO4,再加入浓氨水直到深蓝色沉淀形成然后溶解,定容至1 L)和溶液B(在900 mL去离子水中加入436 g 硫代硫酸钠,定容至1 L)混合,加三倍水稀释,立即使用
二、试验方法
1. 通过SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳分离蛋白质;
2. 将凝胶浸泡在至少5倍体积的固定液中,室温下平缓摇动4 - 12 h,使蛋白固定;
3. 弃去固定液,加至少5倍体积的30%乙醇,室温下平缓摇动30 min;
4. 重复步骤3;
5. 弃去乙醇,加10倍体积的纯水(去离子水),室温下平缓摇动10 min;
6. 重复步骤5两次;
7. 弃去清洗用水,加5倍体积的硝酸银溶液,室温下平缓摇动30 min;
8. 弃去硝酸银溶液,用纯水(去离子水)漂洗凝胶两面,每面20 s;
9. 加5倍体积的新鲜显影液,室温下平缓摇动,数分钟内出现蛋白质的染色条带,继续至条带清晰;
10. 用1%乙酸清洗凝胶终止反应,再用纯水(去离子水)水漂洗数次,每次10 min。
银染后的凝胶可以通过凝胶成像系统或扫描仪转化为照片,或者可以直接用手机拍摄。
在银染实验中,纯水(去离子水)水质非常重要,对实验成功与否起着关键性的作用。有用户在实验中忽略了这一点,纯水水质不佳,导致氯离子含量超标,浸泡时出现硝酸银沉淀,沉淀在胶上,Z后显影的时候看到的是一片花花的乱象,影响了染色效果。
氯化银的溶解度通常是2 ppm,氯离子是水中常见的一种离子杂质,如果水中的氯离子超过2 ppm,即有可能出现杂质,也就是说,对于银染实验,对于纯水质量的要求还是比较苛刻的,一般的反渗透纯水(RO)设备,还难以达到要求。
另外,水中的颗粒物也会吸附银离子沉淀显色,污染背景,甚至让好好的凝胶成了“大花脸”。因此制备出来的纯水在使用前,还应该通过0.22或0.45μm的过滤器预先过滤,以去除水中的颗粒物。
专业来讲,银染用水应该尽量选用符合国标《分析实验室用水规格和试验方法》(GB/T 6682-2008)(参考链接 http://rephile.com.cn/web/news-1686465.html)二级纯水以上的水——电导率至少应当在 1 μS/cm以下。因此,银染用水应当使用EDI纯水或者DI纯水,而RO 纯水是不能满足银染用水需求。
国内做实验室EDI纯水设备的厂家很少。乐枫是国内Z早生产EDI实验室纯水设备的供应商。乐枫新一代 Genie G 智能型一体化超纯水系统可以同时制备EDI 纯水和超纯水。Genie G 生产的 EDI 纯水水质完全满足银染实验,还可以用来配制其他相关实验的试剂;超纯水可以应用于银染实验的上下游以及其他蛋白质研究实验,例如蛋白SDS-PAGE电泳、Western Blotting等。取水终端安装的RephiBio滤器,可以制备无热原(内毒素)、核酸酶、细菌的超纯水,用于生化分析和分子生物学。Genie G一机两水,高度集成,可以充分满足高端生命科学实验室整体用水的需求,质量不输进口设备,用户使用起来,完全可以“用水无忧”。
关于上海乐枫生物科技有限公司
上海乐枫(Rephile Bioscience,ltd.) 是一家专业从事高端水纯化和实验室分离纯化产品研发、设计和制造的高新技术企业,为高科技生物技术和生命科学领域的用户服务。乐枫公司着眼于发展,在ZG、美国、法国、印度、南非等近20个国家建立了销售机构,同时也为国际大型公司提供OEM和ODM,产品销往包括欧美的近100个国家。成立十余年,乐枫持续投入研发,创立出了自己的产品品牌RephiLe(瑞枫),推出了多个全新概念产品- 无线连接的Genie系列纯水系统和智能型大流量纯水工作站Super-Genie等,拥有了三十多项ZL和多个软件著作权。目前乐枫纯化柱填料配方齐全,也提供多款密理博纯水系统的兼容耗材。
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关键词:纯水, 银染, 蛋白质, 凝胶, SDS-PAGE,上海乐枫, RephiLe, Genie 纯水机, Super-Genie 纯水机
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