酶解or超声?看小美非接触超声波DNA打断仪如何大显身手
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在NGS检测实验中,DNA文库构建的第一步就是将DNA随机打断成符合各测序平台读长的片段。相信熟悉NGS文库构建的科研人员一定纠结过这个问题,是用酶解打断还是超声波打断?
目前DNA打断的最主要的方法超声法和酶解法。但是这两种方法在实际使用中各具优势,需要根据实验者自身的情况进行选择。
超声波打断法:
操作简单,耗时短,成本低;随机片段化,无GC序列偏好;剪切效果不受DNA浓度影响
片段化结果集中度高,目的长度片段得率高。
酶切法:
实验要求严格,针对不同样本合适的片段化条件摸索不易,成本较高;存在序列偏好性;需要根据样本浓度改变酶浓度,酶活性易受到溶液成分影响;目标长度片段集中度较低。
超声打断法的优势显而易见,而常用的超声波打断仪分为接触式和非接触式。相比传统的探头超声波破碎仪,探头与样品直接接触,一次只能处理一个样品,实验周期长。小美非接触超声波DNA打断仪Plus系列产品可在密闭容器下进行破碎,不产生感染性飞雾,超声探头与样品不接触,避免交叉污染。对于每天要处理多个样品或者贵重样品的实验室,此款仪器具有处理高通量,样本低损耗,无交叉污染等优势。逐渐成为ChIP(染色质免疫共沉淀)和DNA剪切研究平台不可缺少的标准化工具。
小美超声非接触超声波DNA打断仪Plus系列产品具有通量高、实验一致性好,实验重复性好、片段得率高等优点。专为二代测序DNA样本与染色质免疫共沉淀实验样本前处理量身订做的,应用领域包含:细菌细胞破碎、蛋白质抽提;二代测序样本DNA片段化;霉菌孢子破碎、乳化、均质、加速溶解、催化反应等。
采用等温、非接触的方式对样品进行打断、匀浆和混合;用于无菌、可超微量破碎,隔着离心管能打断染色体。深受各大基因公司、生物公司、测序公司的青睐!
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- 酶解or超声?看小美非接触超声波DNA打断仪如何大显身手
在NGS检测实验中,DNA文库构建的第一步就是将DNA随机打断成符合各测序平台读长的片段。相信熟悉NGS文库构建的科研人员一定纠结过这个问题,是用酶解打断还是超声波打断?
目前DNA打断的最主要的方法超声法和酶解法。但是这两种方法在实际使用中各具优势,需要根据实验者自身的情况进行选择。
超声波打断法:
操作简单,耗时短,成本低;随机片段化,无GC序列偏好;剪切效果不受DNA浓度影响
片段化结果集中度高,目的长度片段得率高。
酶切法:
实验要求严格,针对不同样本合适的片段化条件摸索不易,成本较高;存在序列偏好性;需要根据样本浓度改变酶浓度,酶活性易受到溶液成分影响;目标长度片段集中度较低。
超声打断法的优势显而易见,而常用的超声波打断仪分为接触式和非接触式。相比传统的探头超声波破碎仪,探头与样品直接接触,一次只能处理一个样品,实验周期长。小美非接触超声波DNA打断仪Plus系列产品可在密闭容器下进行破碎,不产生感染性飞雾,超声探头与样品不接触,避免交叉污染。对于每天要处理多个样品或者贵重样品的实验室,此款仪器具有处理高通量,样本低损耗,无交叉污染等优势。逐渐成为ChIP(染色质免疫共沉淀)和DNA剪切研究平台不可缺少的标准化工具。
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采用等温、非接触的方式对样品进行打断、匀浆和混合;用于无菌、可超微量破碎,隔着离心管能打断染色体。深受各大基因公司、生物公司、测序公司的青睐!
- 国货之光 突出重围|小美非接触超声波DNA打断仪Plus系列
近年来国家对国产科研仪器的政策利好不断,国产仪器的产品力也在持续提升。今年9月初,国务院常务会议确定以政策贴息、专项再贷款等一系列“组合拳”,来支持高校、职业院校、医院、中小微企业等领域的设备购置和更新改造。意味着全国数千亿级医疗设备更新改造需求即将释放,科学仪器行业将迎来市场需求持续扩张时期。
上海净信作为国内知名科学仪器厂商在研发上面不断投入,在技术及定制化服务等领域也不断突破。旗下公司小美超声的非接触超声波DNA打断仪Plus系列产品是专为二代测序DNA样本与染色质免疫共沉淀实验样本前处理量身订做的,拥有全新的超声破碎技术!应用领域包含:细菌细胞破碎、蛋白质抽提;二代测序样本DNA片段化;霉菌孢子破碎、乳化、均质、加速溶解、催化反应等。
这个系列产品具有通量高、实验一致性好,实验重复性好、片段得率高等优点。采用等温、非接触的方式对样品进行打断、匀浆和混合;用于无菌、超微量破碎,隔着离心管能打断染色体。
实验效果:
1. DNA样本来源:gDNA 来源于λ噬菌体,浓度为:20 ng/ul 。
实验目的:琼脂糖凝胶电泳检测打断效果
1-24号样本大度啊厚电泳检测结果
深受各大基因公司、生物公司、测序公司的青睐!
用户群体:
高校/科研院所生物分子平台
医院中心实验室/产前诊断科/生殖医学部门/生物样本库
二代三代测序公司/医检所/生物试剂(药物)研发企业
疾控系统、出入境检疫、海关、食药监等
- 打破国外垄断的中国好仪器|上海净信非接触超声波DNA打断仪Plus系列新品
科学发展离不开先进的科学仪器,但目前我国一些高端的科学仪器还依赖着进口,被国外公司垄断。高端科学仪器已成为我国战略性新兴产业之一,是关键“卡脖子”技术,亦是财税支持的重点领域之一。
近年来国家政策利好不断,国产高端科学仪器面临着机遇与挑战并存的局面。
补齐国产高端仪器短板 打破国外垄断
上海净信作为国内知名科学仪器厂商在研发上面不断投入,在技术及定制化服务等领域也不断突破。
秉承着用科技创新的力量,推动高端科学仪器国产化!近日,净信旗下公司小美超声也发布了非接触超声波DNA打断仪Plus系列新品,专为二代测序DNA样本与染色质免疫共沉淀实验样本前处理量身订做。媲美国外进口仪器,是打破国外垄断的中国好仪器!
应用领域包含:细菌细胞破碎、蛋白质抽提;二代测序样本DNA片段化;霉菌孢子破碎、乳化、均质、加速溶解、催化反应等。
伴随着科技的发展,NGS已成为目前炙手可热的检测技术。超声技术可以提供随机、准确、集中无偏差的核酸片段化结果,是测序行业内的金标准,是众多知名基因测序仪公司的推荐方法。
科技与创新
01、传统探头超声波破碎仪
探头与样品直接接触,一次只能处理一个样品,实验周期长。对于多个样品,需要重复使用同一探头,容易造成样品交叉污染。
02、非接触式超声波DNA打断仪
样品可在密闭容器下进行破碎,不产生感染性飞雾,超声探头与样品不接触,避免交叉污染。对于每天要处理多个样品或者贵重样品的实验室,非接触超声波DNA打断仪具有处理高通量,样本低损耗,无交叉污染等优势。逐渐成为ChIP(染色质免疫共沉淀)和DNA剪切研究平台不可缺少的标准化工具。
产品优势
小美超声非接触超声波DNA打断仪Plus系列产品具有通量高、实验一致性好,实验重复性好、片段得率高等优点。
基因测序技术已成为极其重要的专业技术之一,非接触超声波DNA打断仪在高通量测序片段化DNA中的应用也越来越广泛。
小美Plus系列超声波DNA打断仪采用等温、非接触的方式对样品进行打断、匀浆和混合;用于无菌、超微量破碎,隔着离心管能打断染色体。
深受各大基因公司、生物公司、测序公司的青睐!
相信发展国产高端科研仪器,不仅是撬开卡住我们脖子的那只手,更是给我国高科技的未来发展,打下了坚实的基础。
- 脊髓性肌萎缩症SMN | 看HTRF如何大显身手
脊髓性肌萎缩症(SMA)
脊髓性肌萎缩症(SMA),是一类由脊髓前角运动神经元变性导致肌无力、肌萎缩的疾病。由运动神经元功能基因(SMN1) 隐性突变引起,属常染色体隐性遗传病,临床并不少见。主要临床表现为进行性、对称性,肢体近端为主的广泛性弛缓性麻痹与肌萎缩,智力发育及感觉均正常。
SMN1基因编码存活运动神经元(SMN)蛋白 ——一种遍布全身的蛋白质,对于运动神经元细胞的结构维持和功能至关重要。大脑和脊髓中的运动神经元控制整个身体的肌肉运动。如果没有足够的功能性SMN蛋白,那么运动神经元就会死亡,导致衰弱且通常致命的肌肉无力。由SMN1基因突变引起的SMA通常根据发病年龄和严重程度分为几种亚型;其中婴儿发病的SMA是Z严重和Z常见的亚型。患有这种疾病的儿童头部抬头,吞咽和呼吸都有问题。这些症状可能在出生时出现,也可能在6个月后出现。
近十年来,在针对SMA患者的ZL策略方面取得了显著进展:2016年12月Nusinersen反义寡核苷酸疗法迅速获得FDA批准用于所有年龄的SMA患者,可提高SMN蛋白表达并改善轻度SMA儿童和青少年的运动功能;2019年5月批准的静脉注射表达SMN1 cDNA (scAAV9-SMN)的 重组腺相关病毒基因疗法onasemnogene abeparvovec-xioi用于提高2岁及以下婴儿的生存和运动机能。
因为SMN水平无法在活着的患者的神经系统中测量,有关疾病相关的SMN表达水平变化和与疾病相关的数据很少。了解SMN在正常和患病人群、以及发展ZL过程中的动态表达变化将有助于进一步优化临床ZL。
来自约翰霍普金斯大学医学院的研究人员对临床SMA患者进行分组,对分离的人的脑、脊髓、髂腰肌、隔膜、肝等组织中SMN mRNA和蛋白水平分别进行了量化动态检测。其中,采用HTRF®(均相时间分辨荧光,Homogeneous Time-Resolved Fluorescence)检测技术进行不同组织的SMN蛋白定量检测。研究发现围产期全组织SMN蛋白水平正常下降,这支持临床上在出生后要尽快开始SMN诱导ZL;部分患者由于ASOs(反义核苷酸)在脊柱和大脑吻侧区域的分布有限,可能限制了这些区域的运动单元对这些患者的临床反应。这些结果对SMA患者的优化ZL具有重要意义,并为进一步研究提高鞘内注射ASOs的生物利用度提供了依据。
文章技术路线:
HTRF定量脊髓标本中SMN蛋白的表达数据(对照组为75例;n = 16例SMA,患者年龄从15周妊娠(GA)到168个月不等),如下图所示:
HTRF实验方法:
HTRF®(均相时间分辨荧光,Homogeneous Time-Resolved Fluorescence)技术基于时间分辨荧光(TRF)和荧光共振能量转移(FRET)两大技术原理。将荧光的灵敏性、均相免洗和低背景等特点结合在一起。广泛用于GPCRs,激酶,细胞因子,磷酸化蛋白,表观遗传,生物大分子(抗体)等靶点的检测和定量。
HTRF SMN assay kit:将10 μL细胞裂解液转移到96/384浅孔板中,加入5μL的荧光供体(Donor)和5 μL的荧光受体(Acceptor)。孵育过夜后,直接在EnVision多模式读板仪(PerkinElmer)或其他HTRF®兼容的酶标仪上进行读值即可。
珀金埃尔默公司一如既往的为用户提供客制化高灵敏度检测试剂和高品质的检测设备:
EnVision多标记微孔板读板仪
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获取详细产品信息
EnSight多标记微孔板读板仪
Victor Nivo多标记微孔板读板仪
参考文献
1. Ramos, Daniel M., et al. "Age-dependent SMN expression in disease-relevant tissue and implications for SMA treatment." Journal of Clinical Investigation 129.11 (2019): 4817-4831.
- 冻存管如何去除RNA酶,DNA酶
- 览聚氨酯前世今生,看近红外大显身手
1937年,德国化学家奥托·拜耳博士发明了我们称之为聚氨酯的多功能塑料。聚氨酯是通过多元醇与异氰酸酯反应生成的,必要时还可使用适当的催化剂和添加剂。
由于多种异氰酸酯和多种多元醇均可用于生产聚氨酯,因此可以生产出多种形式的聚氨酯材料来满足不同应用的特定要求,如:硬质泡沫、软质泡沫、弹性体、胶粘剂、涂料、密封胶。目前,聚氨酯制品已广泛应用于家居、建筑、日用品、交通、家电等领域。
在不同类型的聚氨酯生产过程中,均需要通过检测某些参数来保证成品质量,如:多元醇的羟值、酸值、颜色、水分含量,异氰酸酯的NCO 含量、水分含量,聚氨酯的 NCO 含量、水分含量、酸值。
使用传统分析技术测定上述参数是一个漫长且具有挑战性的过程,因为测定这些参数需要使用多种不同的分析技术,不仅需要消耗大量的时间来分析样品,还需要花费时间进行仪器管理和维护。
毫无疑问,在生产过程中进行更加严格的质量保证和质量控制是一种必然趋势,这种趋势同时还伴随着对低成本、高效率分析方法的更加关注。近红外光谱作为聚氨酯行业公认的快速可靠的质量控制方法,一分钟内即可同时测定多个参数,且无需样品前处理或使用任何化学品,即使是非专业人员,也可轻松操作。
瑞士万通在聚氨酯分析方面拥有丰富的专业知识,并为此提供了解决方案——DS2500 近红外光谱分析仪(固/液两种版本),可用于快速测定多元醇、异氰酸酯和聚氨酯的多个质量参数。
对于多元醇的羟值和异氰酸酯的 NCO 含量测定,瑞士万通还可提供现成的预校准模型,开箱即用,免去了从零开发模型的困难,让您从开机第 一天就充分发挥生产力。
瑞士万通 DS2500 近红外光谱分析仪可为聚氨酯生产过程中的各个阶段保驾护航,不仅省时省力,而且绿色环保,更可为您节省高达90%的运行成本。
以多元醇的羟值测定为例,比较传统分析方法(滴定)和近红外光谱法的运行成本:
对质量控制过程的低估是导致内外部产品不合格的主要因素之一,据报道,这会导致10-30%的营业额损失。由于传统分析方法存在的诸多弊端,越来越多的企业开始选择在其质量控制过程中使用近红外光谱作为一种快速高效的替代方法。
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新冠肺炎疫情之下,口罩,毫无疑问成了全国人民关注的热点,“一罩难求”成为困扰很多人的难题。前些天公布的1例确诊病例,一男子在菜场买菜时,没戴口罩15秒就感染了新型冠状病毒,可怕至极啊!现在出门戴口罩成了必需的步骤,不戴口罩真的很没安全感,可想要买到真口罩也不是很容易的事。需要预约和限购、口罩价格疯涨、缺货、骗子微商横行,各地市场监督局在严打假冒伪劣口罩,那么我国到底每天能生产多少口罩呢?
事实上,ZG是一个口罩产业大国,生产了约50%的口罩。在疫情发生之前,ZG口罩Z高日产为2000多万只。2019年,ZG大陆地区口罩产量超过50亿只,产值高达102.35亿元。一年50亿只,分到每个人身上也就不到4只,而且在有些高风险的情况下,口罩每4小时就需要更换一次。面对新冠疫情横行,14亿人的需求,这就显得杯水车薪了。
ZY赴湖北指导组成员、工信部副部长王江平曾在接受媒体采访时指出,ZG口罩每天2000万的产能是所有口罩的,医用外科口罩产能是220万,医用N95口罩产能仅有约60万。虽然目前我国口罩生产企业陆续复工,但每天口罩的需求也会达到过亿。按照此前官方公布的每天2000万个口罩产能,对于当下的情形,缺口非常明显。
口罩看起来很简单,但是它的生产流程却是复杂的。口罩的生产一般是全自动或半自动的,每个环节若不以GX率的状态工作都会影响着口罩的产能。不管是全自动还是半自动生产都缺少不了耳带点焊这个环节,这也也是所有环节中极其关键的。
上海净信旗下小美超声近日发明的“超声波点焊机”也广泛运用到了口罩生产领域,大大提高了口罩生产的效率。
例如小美XM-800T手持式超声波点焊机,此款设备外观精美,性能可靠。采用超声波焊接原理,把口罩耳带焊接到口罩本体上,操作方便且适用不用类型的口罩加工焊接。这款仪器工作频率为25KHz,功率800瓦,可连续发波间歇发波,也可长时间工作。
仪器采用大屏幕显示,ZY微机集中控制,超声时间,功率任意设定,样品温度检测显示、频率微机跟踪、故障自动报警。所有功能都显示在4.3寸TFT触摸屏中。相关产品信息也可咨询客服。
面对口罩生产的困顿,上海净信也在努力献上自己的力量。
我们不生产口罩,却是口罩生产中的重要环节!
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