DNA测序鸟枪法
手工测序以及自动测序均属于DNA序列测定,手工测序可分为maxam-gilbert化学降解法与sanger双脱氧链终止法,事实上,目前dna序列分析的主流是自动测序。373型、377型、310型、3700和3100型等多种型号DNA测序仪均已经被美国pe abi公司生产出来了,在这几款DNA测序仪中,临床检测实验室使用Z多的一种型号要属310型。
鸟枪法
“鸟枪法”指的是一种目的基因通过生物基因组进行提取的方法。
这种方法也就是应用基因工程技术实现对目的基因分离的目的,将直接分离基因的难关绕过,目的基因在基因组DNA文库中筛选出是其特点。也可以说这就是对“溜散弹射击”原理的利用来对某个基因进行“命中”,因为在整个基因组中目的基太少太小,相当程度上必须“碰运气”因此,这个方法有叫做“散弹枪”实验法或者“鸟枪法”。
首先生物细胞染色体DNA在酶化学方法(如限制性内切核酸酶)或者物理方法(如剪切力、超声波等)的作用下被切割,获得基因水平的许多片段,然后结合这些片段与适当的载体,在受体菌中转入重组DNA扩增,使无性繁殖的基因文库获得,再和筛选方法相结合,将含有某一基因的菌株从众多的转化子菌株中选出,从中分离、回收重组的DNA。
21世纪di一个十年里,DNA测序与生物云计算、个性化分子诊断、基因芯片、人类基因组计划等等吸引无数眼球的热门词汇息息相关。在创意新天地里,生物技术和信息技术相互融合,相互作用,相互影响。
该仪器的应用相当地广泛,能够进行进行dna测序、杂合子分析、单链构象多态性分析(sscp)、微卫星序列分析、长片段pcr、rt-pcr(定量pcr)等分析,临床上不但能够进行常规dna测序,而且还能够进行法医学上的亲子和个体鉴定、微生物与病毒的分型与鉴定、基因突变检测、hla配型、单核苷酸多态性(snp)分析等。该仪器之所以有如此多的用途是因为该仪器具有dna测序,pcr片段大小分析和定量分析等功能。
步骤
1.目的片段的大片段InsertDNA使用限制酶切下,并用凝胶电泳进行回收。
2.用物理方法(如超声波等)切断处理回收的大片段DNA,用T4DNAPolymerase末端平滑化小片段DNA。
3.进行电泳,切胶将1kbp~2kbp的小片段DNA回收,之后将一个A碱基在DNA的3'端用BcaBestDNAPolymerase加上。
4.在T-Vector中连入加上A-tail的DNA片段,然后转化,对克隆进行挑选。
5.DNA测序阳性克。。
6.编辑数据,Z后使一条大片段的DNA序列连成。
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