解决水体病毒检测挑战,赛默飞助力水生动物疫病监测
鱼类病造成了养殖业和渔业的重大经济损失,《2022年中国水生动物卫生状况报告》显示,水产养殖因病害问题造成的经济损失约539亿元。在中国农业农村部发布的Z新版《一、二、三类动物疫病病种名录》中,共列了22种鱼类病,其中二类动物疫病11种,三类动物疫病11种,这些疾病由细菌、病毒、寄生虫、真菌等引起。
由于鱼类生活在水中,水体作为媒介容易传播病原体,导致疾病的扩散,所以针对病原体的检测和诊断是非常重要的一环。通过准确地检测水体中的病毒,可以及时采取相应的防控措施,避免疫病的扩散和经济损失的发生。
但是水体病毒检测面临很多挑战,比如水体中病毒高度稀释,病毒颗粒和核酸的丰度比较低,样本的高度异质性等。因此,病毒富集就成为了水体病毒检测工作流程中必不可缺的一步。
图1 水体病毒检测实验流程
现有病毒富集常用方法,耗时长,且无法特异性富集病毒,容易造成杂质对实验结果的干扰。
*中国行业标准WS/T 799-2022中的方法
图2 常用水体病毒富集方法
赛默飞可提供全新的从病毒富集到PCR/qPCR检测的完整水体病毒检测解决方案。使用Applied Biosystems MagMAX Wastewater Ultra Nucleic Acid Isolation Kit搭配KingFisher核酸提取仪45分钟内即可完成样本富集和提取,下游通过PCR或qPCR分析检测病毒核酸。
图3 赛默飞完整水体病毒检测解决方案
案例分享
从鳜鱼养殖水样中使用赛默飞水体病毒检测解决方案富集提取DNA病毒-鳜蛙虹彩病毒(MRV)和RNA病毒-鳜弹状病毒(SCRV)。
图4 MRV经过PCR后电泳图 1-4水样;5阴性对照
图5 SCRV经过RT-PCR后电泳图 1-4水样;5阴性对照
图6 MRV和SCRV qPCR结果 MRV Ct 28.5;SCRV Ct 37.7
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