小罗开讲 | 下一代测序技术在肿瘤类器官中的应用
早在20世纪80年代,科学家就提出了类器官“organoid”一词,直到2009年,荷兰Hubrecht研究所的Hans Clevers团队成功地将成体干细胞培养成小肠的隐窝和绒毛结构,这也标志着类器官的研究进入了新的时代。在之后的5年内,结肠[1]、小肠[2]、视网膜[3]、大脑[3]、肝脏[4]、胃[5]和乳腺[6]等人源类器官相继开始建立。2022年8月,FDA批准了全球首个基于“类器官芯片”研究获得临床前数据的新药进入临床试验(NCT04658472),用于治疗成人慢性炎症性脱髓鞘性多发性神经疾病。
一
类器官的定义与分类
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二
肿瘤类器官与下一代测序
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三
WES助力肿瘤类器官筛选鉴定
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四
RNA-seq助力肿瘤类器官表达谱监测
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NGS技术能够为类器官的研究提供分子遗传学的有效证据,例如培养方式的选择、培养过程的监测、构建结果的质控等,以确保构建完成的PDO能够保持与患者肿瘤组织中变异特征的高度相似性,从而使离体模型Z大程度地还原体内组织环境。在此基础上,NGS技术有效助力肿瘤类器官应用于功能基因组筛选、潜在药物靶点发现、高通量药物筛选及药敏测试,从而助力针对肿瘤不同基因型的个性化医疗策略制定。
五
助力类器官研究
作为全球体外诊断领域的领导者,罗氏诊断通过创新、高质量的产品和优质的服务,帮助用户进行基于高通量测序技术的广泛研究和医学应用。罗氏提供了领先的高通量测序样本制备全流程解决方案,其中包括从样本前处理、文库构建、靶向捕获到数据分析等完整解决方案。此外,罗氏还基于其在测序领域的丰富经验和技术创新,开发了全球领先的全自动测序文库制备系统,为用户提供更高效、可靠的服务。
1
KAPA高性能文库构建
罗氏诊断为类器官研究提供高品质的文库构建方案,采用高效、高保真的扩增体系,并有效兼容组织样本,为靶向测序、全外显子组测序或全基因组测序等提供全流程解决方案,高效助力类器官的分子遗传学评估和验证。
DNA文库构建试剂盒:
KAPA HyperPrep:行业金标,卓越表现
KAPA HyperPlus:酶切打断,样本兼容
KAPA EvoPlus:流程简化,无噪建库
RNA文库构建试剂盒:
KAPA RNA HyperPrep:可搭配rRNA去除&mRNA富集两种前处理方案,为RNA-seq提供稳定、高效的链特异建库方案
2
全新HyperExome V2 搭配HyperCap靶向富集体系
序氏再进,品质传承。2023年,具备高性能全外显子组的罗氏KAPA HyperExome V2全外显子组探针隆重上市,适配DNA和RNA预文库捕获。罗氏超过15年的专业设计和精细的测试优化,在覆盖全新基因和位点数据库的同时,能够解锁更多基因组困难区域。搭配KAPA HyperCap靶向富集工作流程,获得更高质量测序数据,从而有效助力类器官的筛选验证。
设计更优:覆盖关键基因数据库中的更多区域
卓越覆盖:优异数据库区域覆盖率,为检测结果增加可信度
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参考文献
*仅用于科学研究,不用于临床诊断 MC-CN-03533
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