1999年(不予资助类)
大连理工大学 染料及表面活性剂精细加工合成国家ZD实验室
南开大学 吸附分离功能高分子材料国家ZD实验室
天津大学、清华大学 一碳化工国家ZD实验室
2000年
北京大学 暴雨监测与预测国家ZD实验室
北京大学 湍流研究国家ZD实验室
ZG科学院兰州地质研究所 气体地球化学国家ZD实验室
中山大学 超快速激光光谱学国家ZD实验室
2001年
江苏省原子医学研究所 核医学国家ZD实验室
兰州大学 干旱农业生态国家ZD实验室
ZG科学院植物生理生态研究所 植物分子遗传国家ZD实验室
ZG农业大学 农业生物技术国家ZD实验室
中山大学 生物FZ国家ZD实验室
上海计划生育研究所 计划生育药具国家ZD实验室
2002年
华中科技大学 图象信息处理与智能控制教育部ZD实验室
北京大学 文字信息处理国家ZD实验室
ZG科学院计算技术研究所 智能信息处理中科院ZD实验室
电子科技大学 宽带光纤传输与通信系统技术国家ZD实验室
2003年
ZG科学院化学所 工程塑料研究国家ZD实验室
同济大学 混凝土材料研究国家ZD实验室
上海交通大学 薄膜与微细技术教育部ZD实验室
西安交通大学 机械结构强度与振动国家ZD实验室
清华大学 煤的清洁燃烧技术国家ZD实验室
2004年
南开大学 吸附分离功能高分子材料国家ZD实验室
2005年
南京大学 近代声学国家ZD实验室
一碳化学与化工国家ZD实验室
原名一碳化工国家ZD实验室,依托清华大学、天津大学建设,1999年国家ZD实验室评估较差,2001年经科技部批准重组为一碳化学与化工国家ZD实验室,加入太原理工大学共同建设,2002年12月集中考核未通过,已被摘牌。
2003年一碳化学与化工国家ZD实验室(清华分室)经整合后申报为有机光电子与分子工程教育部ZD实验室。
暴雨监测与预防国家ZD实验室
原名暴雨测定与预报国家ZD实验室,依托北京大学建设,2000年国家ZD实验室评估较差,2002年12月集中考核未通过,已被摘牌。
文字信息处理国家ZD实验室
该实验室依托北京大学建设,2002年国家ZD实验室评估较差(起初公布结果为待定,经讨论后评估结果为差),已被摘牌。
煤的清洁燃烧技术国家ZD实验室
原名煤的GX低污染燃烧国家ZD实验室,依托清华大学建设,2003年国家ZD实验室评估较差,已被摘牌。
吸附分离功能高分子材料国家ZD实验室
依托南开大学建设,1999年国家ZD实验室评估较差,2002年12月集中考核获通过,2004年国家ZD实验室评估较差,已被摘牌。现降格为吸附分离功能高分子材料教育部ZD实验室。
核医学国家ZD实验室
依托江苏省原子医学研究所建设,2001年国家ZD实验室评估较差,2002年12月集中考核未通过,已被摘牌。
机械结构强度与振动国家ZD实验室
依托西安交通大学建设,2003年国家ZD实验室评估较差,已被摘牌。现降格为机械结构强度与振动教育部ZD实验室。
混凝土材料研究国家ZD实验室
依托同济大学建设,2003年国家ZD实验室评估较差,已被摘牌。经整改2005年申报为先进土木工程材料教育部ZD实验室。
近代声学国家ZD实验室
依托南京大学建设,2005年国家ZD实验室评估较差,已被摘牌。现降格为近代声学教育部ZD实验室。
干旱农业生态国家ZD实验室
依托兰州大学建设,2001年国家ZD实验室评估较差,2002年12月集中考核未通过,已被摘牌。现降格为干旱与草地生态教育部ZD实验室。
计划生育药具国家ZD实验室
依托上海市计划生育科学研究所建设,2001年国家ZD实验室评估较差,2002年12月集中考核未通过,已被摘牌。
宽带光纤传输与通信系统技术国家ZD实验室
依托电子科技大学建设,2002年国家ZD实验室评估较差,已被摘牌。
工程塑料研究国家ZD实验室
依托ZG科学院化学所建设,2003年国家ZD实验室评估较差,已被摘牌。
气体地球化学国家ZD实验室
依托ZG科学院兰州地质研究所建设,2000年国家ZD实验室评估较差,2002年12月集中考核未通过,已被摘牌。
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