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已知蛋白质N端序列,要想扩增其全基因,怎样设计引物?从5'端or3‘端

ziyuli4990 2009-11-22 20:00:43 403  浏览
  • 请详细点,谢谢

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全部评论(1条)

  • 一龙太二 2009-11-23 00:00:00
    首先请上NCBI BLAST搜索之(blastp)。或许可以直接查到你研究物种的基因序列。即使没有,有近缘物种的基因序列也是个好的参考,通过比对,选择序列保守区设计引物。 若搜索不到任何信息,就需要通过设计兼并引物。比如你的蛋白质N端序列为 MTAGSR... 上游引物即为5'-ATG NNN NNN ...-3'(参考那个密码子表,和兼并碱基的标法,吾手头没有,记不住额) 下游引物就得反过来,假设蛋白序列为 N-XX-C 其编码DNA为 5'-GAN GAN-3' 则下引物为 5'-NTC NTC-3'

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