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测序后如何分析基因突变?

北温1998 2011-03-20 05:39:12 915  浏览
  •  

参与评论

全部评论(1条)

  • xiaofeitiandg 2011-03-21 00:00:00
    1. 假设你测的是一个基因的序列,如果已知这个基因的序列,则将你测序得到的基因序列与已知的序列相比对,分析看两者在哪个地方不对应,不对应的地方即为突变的地方。比对的软件有sequencher,或者去NCBI网站点击BLAST进行。 2. 如果你测的是一个以前未知的序列,那么要测几个不同的单克隆,将测得的结果进行比对,分析一致的地方以及不一致的地方。

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单细胞分析测序用氟油Surf-DG7500试剂

单细胞测序技术,是在单个细胞水平上,对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项新技术。它能够揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性,在肿瘤、发育生物学、微生物学、神经科学等领域发挥重要作用,正成为生命科学研究的焦点。

单细胞测序技术自从2009年首次问世,在这十几年以来持续不断地发展。2013年,《Science》杂志将单细胞测序列为年度最值得关注的六大领域榜首,《Nature Methods》杂志将单细胞测序的应用列为2013年年度最重要的方法学进展。2017年10月16日,与 “人类基因组计划” 相媲美的 “人类细胞图谱计划” 首批拟资助的38个项目正式公布,引爆单细胞测序新时代。

微流控技术的液滴单细胞测序技术通过微流控芯片将单个细胞捕获至油滴里面,这种方式的优点是细胞通量高,周期快速,成本低,细胞捕获效率高,并且商业化仪器操作简便。其核心思想是将不同的细胞赋予一段不同的barcode序列,建库时,携带相同barcode序列的核酸分子被认为来自同一个细胞,人们就可以一次性为成百上千的细胞建库并顺利区分它们。

在单细胞分析芯片中,用氟油7500包裹携带不同标签(barcode)的凝胶珠(gel beads)和标记的各种细胞酶溶液,形成油包水液滴GEMs。氟油Surf-DG7500试剂可以很好的实现该功能,产生稳定、均匀、不互溶的液滴小球。

单细胞测序用氟油Surf-DG7500试剂呈现液体状态,即开即用,每瓶8mL。



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