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细菌三代测序对dna质检需要用到od值吗

_丶Kinky 2016-05-29 17:21:19 298  浏览
  •  

参与评论

全部评论(1条)

  • 小啦啦gg 2016-05-30 04:29:45
    三代对于DNA有两方面的要求,首先是DNA的量,一般对于Pacbio RSII的P6-C4建库测序方式对于一个样本的DNA量都要求10ug以上总量。此外DNA的质量值也对测序结果有很大影响。影响Z大的还是DNA长度,原始DNA长度直接决定Z后测序获得的sub_reads的读长。P6-C4可以获得长至30kb的reads,所以原始DNAZ好长度至少大于10kb以上。 OD值一定程度上可以反映DNA的质量和纯度情况,如果DNA中含有如蛋白或盐离子甚至次生代谢物都会对Pacbio的测序产生影响。表现在测序数据量底下,甚至只有正常的十分之一数据。

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