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病毒变异vs抗病毒 药物
病毒是一种以DNA或RNA为遗传物质,无独立营养代谢系统,需寄生于宿主内,进行复制和生存的类生物体。病毒在自然界内与宿主共生的过程中,一些病毒可逃脱宿主免疫防御系统,导致宿主发病致死。病毒遗传物质突变几率非常高,可帮助病毒逃脱不断升级的宿主免疫系统。根据病毒进化论学说,病毒发展史要远超过人类进化史,相比之下,人类对病毒知之甚少。随着分子细胞生物学的发展,目前发现病毒种类7000多种,其中可感染人类的病毒有300多种。病毒感染类疾病占传染类疾病的3/4,严重威胁人类健康。从上个世纪60年代开始,已有广谱类的抗病毒 药物出现,但由于病毒突变速度非常快,随后陆续产生病毒耐药性和副作用,导致对病毒类感染疾病无特异性有效药物进行临床ZL。
瑞德西韦——人民的希望?
2020年伊始,COVID-2019肆虐,开发特异性抗新冠病毒 药物迫在眉睫。2月1日《新英格兰杂志》发表论文中,报道美国diyi例新冠肺炎患者病情恶化后,经瑞德西韦(Remdesivir/GS-5734)静脉注射同情用药后病情好转[1]。2月6日,瑞德西韦“双盲临床实验”在武汉市金银潭医院、市肺科医院和协和医院等入组761例患者进行临床评价[2]。“人民的希望”——瑞德西韦抗新冠肺炎临床LX,需等至4月底揭晓谜底。
瑞德西韦是由一直致力于抗病毒领域的吉利德科学公司研发(抗流感药物奥司他韦,商品名达菲,Z早也由吉利德研发,后卖给罗氏进行销售)。2013-2016年(西非)和2018-2019年(刚果)埃博拉病毒肆虐期间,各大制药公司掷重金进行抗埃博拉病毒 药物研发。由美国陆军传染病医学研究所,吉利德科学公司,美国CDC和波士顿大学医学院四家业内ding级实验室联合进行的瑞德西韦抗埃博拉病毒临床前药效学研究,于2016年发表在《自然》杂志[3]。
瑞德西韦分子机制——前药(Prodrug)
三磷酸代谢物有效制止RdRp酶活性
RNA依赖型RNA聚合酶(RNA-dependent RNA-polymerases, RdRp)为广谱的抗病毒 药物开发靶点,目前以RdRp为靶点的抗冠状病毒 药物多为核苷类似物或RNA干扰类[4]。瑞德西韦以前药(Prodrug)形式进入细胞后,通过三步转化为三磷酸代谢物NTP,NTP和天然ATP竞争结合病毒RdRp,插入RNA合成链中,引起病毒RNA合成终止,并YZRdRp酶活性(下图a)[3]。
瑞德西韦结构上的1‘-氰基,一方面针对RdRp酶提供更好的针对ATP竞争的结合活性,另一方面针对病毒RdRp酶提供了比人源RNA聚合酶II和人源线粒体RNA聚合酶(h-mtRNAP)更好的选择性YZ。在Hela细胞水平,瑞德西韦对两种埃博拉病毒和另外三种病毒都有显著浓度依赖型YZ(下图c);且在分子水平,瑞德西韦活性分子NTP能选择性YZ病毒RdRp酶活性(下图e蓝色),而对人源RNA聚合酶II(下图e黑色)和线粒体RNA聚合酶(下图e红色)无明显YZ作用[3]。
瑞德西韦细胞活性——GX选择性
YZ病毒在细胞内复制
研究人员又通过进一步的细胞学实验,分别在不同的细胞模型上评价了瑞德西韦(GS-5734)对埃博拉病毒和其他RNA病毒的抗病毒活性。数据显示,瑞德西韦可在五种细胞模型,包括原代巨噬细胞上有效YZ埃博拉活性;并对呼吸道感染病毒,如RSV和MERS,以及出血热感染病毒,如JUNV和LASV病毒有一定YZ作用;但对其他病毒如CHIV,VEEV和HIV-1,无明显YZ(下表)[3]。
2019年,在《柳叶刀传染病》杂志报道,美国CDC科研人员建立的Zoanthus绿色荧光蛋白(ZsG)标记的埃博拉病毒体外细胞表型快速评价方法(下图左),再次验证了瑞德西韦可在低浓度YZ两个品系(Ituri/Makona)的埃博拉病毒复制,并对细胞活性无明显影响(下图右)。对Ituri品系埃博拉病毒,EC50为12nm,SI(selectivity index,SI)为303倍;对Makona品系埃博拉病毒,EC50为13nm,SI为279倍[5]。
瑞德西韦体内药效——快速扩散至病灶区,
提高模式动物存活率
在恒河猴(rhesus monkeys)动物模型上,按10mg/kg计量静脉注射给药后,检测健康恒河猴体内瑞德西韦(下图a黑色) 及其代谢物,丙氨酸代谢物(下图a红色), 单磷酸代谢物Nuc(下图a蓝色)和三磷酸代谢物NTP(下图a绿色),在不同时间点的血药浓度。数据显示瑞德西韦前药在体内两个小时内达到峰值,随后很快被清除;而其三磷酸活性代谢物NTP在体内,特别是外周血单核细胞(PBMCs)内,可在更长的时间内维持高血药浓度。通过同位素14C标记瑞德西韦药物后,进一步研究药物在体内分部发现,药物可快速到达睾丸、附睾、眼睛和脑部(下图b)[3]。
通过病毒暴露动物模型实验,瑞德西韦通过静脉注射给药后,可显著提高恒河猴实验动物的存活率,特别是在病毒暴露3天后按10mg/kg计量的给药组,其28天后存活率和空白对照组同样可达(下图d),且通过核酸定量方法进一步验证,给药组体内的病毒RNA拷贝数与空白对照组相比得到明显YZ(下图e)[3]。
瑞德西韦抗病毒 药物机制总结
瑞德西韦以RdRp酶为药物靶点,在广谱抗病毒核苷类似物YZ剂中脱颖而出,主要归因于以下三点:1) 对其药物靶点RdRp酶,比其天然底物ATP有更高的竞争亲和性;2)在体外细胞水平,可GX选择性的YZRNA病毒在细胞内复制,并无明显细胞毒性。3)在体内动物水平,有良好的药代学基础,其活性代谢物NTP可快速扩散至病灶,YZ体内RNA复制,提高病毒暴露后模式动物存活率。
试验方法
珀金埃尔默仪器&试剂方案
RNA聚合酶活性检测
[a-32P]-GTP 同位素标记
细胞内病毒感染评价
高内涵细胞成像表型分析平台Opera/Operetta
细胞成像专用微孔板
抗病毒 药物细胞毒性评价
多模式读板仪 EnVision
药物组织分布
[14C]GS-5734 同位素标记
同位素液闪计数仪
病毒基因组测序分析
自动化NGS文库制备工作站 Sciclone G3
抗病毒 药物实验设计及仪器&试剂摘录列表[3,5]
“工欲善其事,必先利其器”。在以上瑞德西韦抗病毒 药物研发实验设计及检测过程中,珀金埃尔默在每一个环节都给一线的科学家们提供了GX的“实验武器”:经典的同位素标记技术,准确分析RdRp活性和药物组织分布;业内金标准EnVision多模式读板仪和高内涵成像表型分析平台Opera/Operetta,快速进行细胞内病毒感染和药物毒性评价;自动化NGS文库制备工作站Sciclone G3,加速病毒基因组快速分析。
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参考文献
1.First Case of 2019 Novel Coronavirus in the United States. NEJM Jan 2020.
2.http://www.wuhan.gov.cn/2019_web/whyw/202002/t20200207_304511.html
3.Therapeutic efficacy of the small molecule GS-5734 against Ebola virus in rhesus monkeys. NatureMarc-h 2016.
4.Coronaviruses — drug discovery and therapeutic options. NATURE REVIEWS DRUG DISCOVERY May 2-016
5.Characterisation of infectious Ebola virus from the ongoing outbreak to guide response activities in the D-emocratic Republic of the Congo: a phylogenetic and in vitro analysis. The Lancet Infectious Diseases Jul-y 2019
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