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- 稳稳雯雯98 2016-12-02 01:02:49
- 原理 Western Blot与Southern印迹杂交或Northern印迹杂交方法类似,但Western Blot采用的是聚丙烯酰胺凝胶电泳,被检测物是蛋白质,“探针”是抗体,“显色”用标记的二抗。经过PAGE分离的蛋白质样品,转移到固相载体(例如硝酸纤维素膜NC膜)上,固相载体以非共价键形式吸附蛋白质,且能保持电泳分离的多肽类型及其生物学活性不变。以固相载体上的蛋白质或多肽作为抗原,与对应的抗体起免疫反应,再与酶或同位素标记的第二抗体起反应,经过底物显色或放射自显影以检测电泳分离的特异性目的基因表达的蛋白成分。该技术也广泛应用于检测蛋白水平的表达。 分类 Western Blot显色的方法主要有以下几种: i. 放射自显影 ii. 底物化学发光ECL iii. 底物荧光ECF iv. 底物DAB呈色 现常用的有底物化学发光ECL和底物DAB呈色,体同水平和实验条件的是用diyi种方法,目前发表文章通常是用底物化学发光ECL。只要买现成的试剂盒就行,操作也比较简单,原理如下(二抗用HRP标记):反应底物为过氧化物+鲁米诺,如遇到HRP,即发光,可使胶片曝光,就可洗出条带。 其他 值得一提的是,western blot 这个名称的由来很有意思。Z开始做印迹工作的是一个叫做Southern的科学家,但印迹的对象是DNA链,他把这种技术称为Southern blot,后来类似的出现了两个过程相似,但是对象不同的印迹方法,一个针对RNA,一个对蛋白质,人们分别把这两种技术的称为Northern和Western,与这两个技术的发明人没有关系了。
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- Western Blot技术篇---样品制备
Western Blot 是一种用于检测蛋白质以及蛋白质翻译后修饰的常用方法,可以对简单或复杂生物样品中的目标蛋白质进行半定量或定量分析。其操作步骤包括:
•从细胞、组织或体液中制备样品(蛋白质提取和蛋白质浓度测量)
•十二烷基硫酸钠(SDS)聚丙烯酰胺凝胶通过电泳按大小分离蛋白质
•将分离的蛋白质固定在硝酸纤维素(NC)膜或聚偏二氟乙烯(PVDF)膜上
•封闭膜上的非特异性蛋白
•用特异性一抗探测靶蛋白
•与标记的化学发光或荧光分子偶联的二抗共孵育
•检测反映抗原/抗体结合的信号
•使用软件对目标蛋白条带进行光密度分析
Western Blot是分子生物学和蛋白质组学中Z常用的技术之一。但Western Blot是一个多步骤的操作流程,因此任何一个步骤发生错误,都会导致的结果发生变异,从而降低了该技术的可靠性和可重复性。有研究表明,Western Blot的一些关键步骤,例如样品制备方法、跑胶、转膜、抗体的选择以及定量所用的归一化方法,对于可再现的蛋白质印迹结果至关重要。
--样品制备--
Western blot步骤中的一个经常被忽视的方面是有效的样品制备。有效的蛋白质提取和纯化步骤对蛋白质印迹实验的结果和解释有重要影响。为了有效地提取蛋白质,应该选择一种合适的均质化方法,该方法可以通过细胞膜的破裂有效地释放细胞内的内容物。另外,应该选择Z佳的裂解缓冲液以促进蛋白质的正确溶解并防止蛋白水解降解,从而获得大量的目标蛋白质。
样品制备的原则
•尽可能采取简单方法,避免蛋白丢失;
•尽可能将所有待分析的蛋白质样品全部溶解;
•细胞和组织样品的制备应尽可能减少蛋白的降解,低温和蛋白酶YZ剂防止蛋白降解;
•提取过程中避免蛋白产生聚集、沉淀和变性;
•防止发生人为的蛋白质样品化学修饰(例如加入尿素不要超过37℃,防止氨甲酰化而修饰蛋白);
•尽可能去除样品中的非蛋白杂质和干扰蛋白;
•样品裂解液新鲜配置,并分装冻存于-80℃。勿反复冻融;
•制备方法应具有标准化、重现性、可靠性和简便性。
蛋白样品的类型
可溶性蛋白:
•培养细胞中可溶性蛋白,包括:细胞质中的可溶性蛋白、细胞周质蛋白、细胞器相关蛋白、分泌到培养基中的可溶性蛋白。
•自然宿主细胞中可溶性蛋白,包括:微生物、植物和动物细胞中的可溶性蛋白。
不溶性蛋白:
•含包涵体的不溶性蛋白
•膜相关蛋白和难溶性蛋白(非重组蛋白)
蛋白样品制备的流程
•组织、细胞或菌体的破碎和裂解
•沉淀溶液中蛋白
•清除杂质
•蛋白浓缩、纯化
组织或细胞破碎和裂解
为了全面分析细胞内的蛋白,需要对组织或者细胞进行有效地破碎和裂解,其方法取决于蛋白样品的来源。同时,因细胞破碎时蛋白酶可能释放出来,从而导致蛋白降解,影响后续实验结果,因此需要加入蛋白酶YZ剂进行保护。
破碎裂解的方法
温和破碎裂解法(针对组分单一或者分析某一特定组分):
•渗透裂解(血细胞、组织培养细胞):将细胞悬浮于渗透溶液中,细胞因肿胀而释放细胞内容物。
•冻融裂解(细菌细胞、组织培养细胞):反复冻融裂解细胞,由于细胞内冰粒形成和剩余细胞液的盐浓度ZG引起肿胀,使细胞结构破碎。
•裂解液裂解(组织、培养细胞):含有去污剂的裂解液处理组织或细胞,使细胞膜破碎,细胞内容物释放出来。
•酶裂解(植物、细菌、真菌细胞):利用酶裂解含有细胞壁的细胞。
•剧烈破碎裂解法(难于破碎细胞:固体组织、坚硬细胞壁):
•超声裂解(悬浮细胞):利用超声波产生的切应力来裂解细胞,超声时应在冰上间歇进行。
•弗氏细胞压碎器裂解(含有细胞壁的细胞):细胞悬液置于高压下QL挤出小孔,压力突然降低以及剪切力的作用导致细胞爆裂破碎。
•机械匀浆裂解(固体组织、细胞悬液):将组织剪成小块,利用匀浆器在加蛋白酶YZ剂的匀浆液中破碎组织或者细胞。
•研磨法(固定组织、微生物):样品冻存在液氮中,利用研钵和研杵快速将样品研磨成粉状。
玻璃珠匀浆裂解(含有细胞壁的细胞):利用剧烈震荡的玻璃珠打碎细胞的细胞壁,从而释放细胞的内容物。
裂解液一般组成
•缓冲液(Tris-HCl):提供pH环境,使蛋白保持稳定,增加溶解性。
•去污剂(表面活性剂):破坏蛋白之间的疏水相互作用,以确保蛋白完全溶解和防止通过疏水相互作用导致蛋白聚合。
•蛋白酶YZ剂:YZ蛋白酶的活性,防止蛋白被水解。
•磷酸酶YZ剂:YZ磷酸酶的活化,防止蛋白样本脱磷酸化。
•还原剂:二硫键断裂和蛋白质变性
•其它:NaCl,促进细胞膜破裂使蛋白溶解。
常见裂解液成份一览表
蛋白酶YZ剂的类型
常用的蛋白酶YZ剂:
丝氨酸蛋白酶YZ剂:PMSF,AEBSF-HCl,Aprotinin(抑肽酶), Chymostatin,亮肽素(Leupeptin)。
天冬氨酸蛋白酶YZ剂:PMSF,碘乙酸、抑肽素(Pepstatin),云芝发酵物。
巯基蛋白酶YZ剂:PMSF,TLCK,TPCK,Antipain-HCl,N-乙基顺丁烯二酰亚胺。
金属蛋白酶YZ剂(金属离子螯合剂):EDTA,EGTA,塔罗肽。
(磷酸酶YZ剂:NaF、激活的原矾酸钠、焦磷酸钠、β-甘油磷酸钠。)
常见的蛋白酶YZ剂一览表
YZ剂
工作
浓度
分子量
YZ蛋白酶种类
稳定性
AEBSF
1mM
MW:239.5
不可逆的丝氨酸蛋白酶YZ剂,YZ胰蛋白酶,糜蛋白酶,纤溶酶,凝血酶及激肽释放酶。
可溶于水,其pH7 的水溶液在4oC 可保持稳定 1-2 个月,在pH>8 的情况下会发生缓慢水解
Aprotinins
抑肽酶
2μg/ ml
MW:6512
可逆的丝氨酸蛋白酶YZ剂,可YZ纤溶酶,激肽释放酶,胰蛋白酶,糜蛋白酶,但不YZ凝血酶和Factor Xa。
非常稳定,当 pH>12.8 时失去活性,可溶于水(10mg/ml),-20oC 下可长期保存。
EDTA, 4Na
10mM
MW:380.2
金属蛋白酶的可逆性螯合物,可能同时影响其他金属依赖性生物过程。
其水溶液很稳定,其贮存液(pH8.5 的 0.5M水溶液)在 4oC 可保存数月
Leupeptin, 半硫酸盐
亮抑酶肽(亮肽素)
100μM
MW:493.6
可逆的丝氨酸及半胱氨酸蛋白酶制剂,可YZ胰蛋白酶样蛋白酶及一些半胱氨酸蛋白酶如:Lys-C 内切蛋白酶,激肽释放酶,木瓜蛋白酶,凝血酶,Cathepsin B 及胰蛋白酶。
工作液的稳定期为数小时,贮存液(10mM 水溶液)在 4oC 时稳定期为一周,-20oC 时稳定期为一个月
Pepstatin A
1μM
MW:685.9
可逆的天冬氨酸蛋白酶,可YZ胃蛋白酶, Cathepain B&L,血管紧张肽原酶(renin)。
以 1mg/ml 溶于甲醇,搅拌过夜可以1mg/ml 溶于乙醇,333mg/ml 溶于 6N 的
PMSF
1mM
MW:174.2
不可逆的丝氨酸蛋白酶YZ剂,可YZ羧肽酶 Y, 糜蛋白酶,Factor Xa,木瓜蛋白酶,纤溶酶,蛋白酶K,枯草杆菌蛋白酶,凝血酶及胰蛋白酶。
有毒!请现配现用,并在样本处理过程中分批加入(勿一次性加入),在 pH7.5 时半衰期为一个小时,贮存液(200mM 的甲醇或乙醇溶液)在 4oC 可保存 9 个月以上
抑肽素 A
很多细菌来源的天冬氨酸蛋白酶,与蛋白酶有微弱的结合。
乙酸,4oC 下可保存一周。
Trypsin Inhibitor,
Soybean
与需YZ的蛋白酶等摩尔浓度
MW:20000
可逆的丝氨酸蛋白酶YZ剂,YZ Factor Xa 及胰蛋白酶。
在低 pH 值情况下分解,其贮存液在-20oC时相当稳定。
Amastatin
10μM
MW:474.6
可逆的丙氨酰-氨基肽酶YZ剂。
其水溶液只可保存一天,其 1mM 的乙醇溶液在-20oC 可保存一个月
Antipain, 2HCl
100μM
MW:677.6
可逆的丝氨酸和半胱氨酸的蛋白酶YZ剂,可YZ木瓜蛋白酶及胰蛋白酶.对纤溶酶也有一定YZ作用.与Leupeptin 相比,它对木瓜蛋白酶和胰蛋白酶有更强的特异性。
工作液稳定期仅为数小时,但其10mM 的水(或缓冲液)溶液贮存液在 4oC 可保存一周,在-20oC 可保存一个月,还可溶于甲醇或DMSO。
Chymostatin
100μM
MW:604.9
可逆的 半胱氨酸丝氨酸蛋白酶YZ剂,可YZ糜蛋白酶样丝氨酸蛋白酶,包括lalpha-,beta-,gamma-及 delta-糜蛋白酶
TLCK
100μM
MW:369.3
不可逆的丝氨酸蛋白酶YZ剂,YZ胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶,包括菠萝蛋白酶,Arg-C 内切蛋白酶, 无花果蛋白酶,木瓜蛋白酶,纤溶酶,凝血酶及胰蛋白酶。
pH>7.5 时非常不稳定,贮存液(10mM 的1mM HCl,pH3.0 的水或甲醇溶液)也应该现配现用。
TPCK
10μM
MW:351.5
不可逆的丝氨酸蛋白酶YZ剂,YZ胰蛋白酶样丝氨酸蛋白酶,包括菠萝蛋白酶,糜蛋白酶,无花果蛋白酶及木瓜蛋白酶。
工作液稳定期为几个小时,贮存液(10mM 甲醇溶液)在 4oC 下可保持稳定几个月。
参考文献:
Protein Purification and analysis: next generation Western blotting techniques, Expert Rev Proteomics. 2017 Nov;14(11):1037-1053.
An Overview of Technical Considerations for Western Blotting Applications to Physiological Research, Scand J Med Sci Sports . 2017 Jan;27(1):4-25.
- ELISA实验原理:ELISA的原理、类型及操作步骤
ELISA实验原理:ELISA的原理、类型及操作步骤
ELISA的原理
ELISA的基础是抗原或抗体的固相化及抗原或抗体的酶标记。结合在固相载体表面的抗原或抗体仍保持其免疫学活性,酶标记的抗原或抗体既保留其免疫学活性,又保留酶的活性。在测定时,受检标本(测定其中的抗体或抗原)与固相载体表面的抗原或抗体起反应。用洗涤的方法使固相载体上形成的抗原抗体复合物与液体中的其他物质分开。再加入酶标记的抗原或抗体,也通过反应而结合在固相载体上。此时固相上的酶量与标本中受检物质的量呈一定的比例。加入酶反应的底物后,底物被酶催化成为有色产物,产物的量与标本中受检物质的量直接相关,故可根据呈色的深浅进行定性或定量分析。由于酶的催化效率很高,间接地放大了免疫反应的结果,使测定方法达到很高的敏感度。
ELISA方法类型和操作步骤
elisa可用于测定抗原,也可用于测定抗体。在这种测定方法中有3种必要的试剂:①固相的抗原或抗体,②酶标记的抗原或抗体,③酶作用的底物。根据试剂的来源和标本的性状以及检测的具备条件,可设计出各种不同类型的检测方法。
(一)双抗体夹心法
双抗体夹心法是检测抗原最常用的方法,操作步骤如下:
(1)将特异性抗体与固相载体连接,形成固相抗体:洗涤除去未结合的抗体及杂质。
(2)加受检标本:使之与固相抗体接触反应一段时间,让标本中的抗原与固相载体上的抗体结合,形成固相抗原复合物。洗涤除去其他未结合的物质。
(3)加酶标抗体:使固相免疫复合物上的抗原与酶标抗体结合。彻底洗涤未结合的酶标抗体。此时固相载体上带有的酶量与标本中受检物质的量正相关。
(4)加底物:夹心式复合物中的酶催化底物成为有色产物。根据颜色反应的程度进行该抗原的定性或定量。
根据同样原理,将大分子抗原分别制备固相抗原和酶标抗原结合物,即可用双抗原夹心法测定标本中的抗体。
(二)双位点一步法
在双抗体夹心法测定抗原时,如应用针对抗原分子上两个不同抗原决定簇的单克隆抗体分别作为固相抗体和酶标抗体,则在测定时可使标本的加入和酶标抗体的加入两步并作一步。这种双位点一步不但简化了操作,缩短了反应时间,如应用高亲和力的单克隆抗体,测定的敏感性和特异性也显著提高。单克隆抗体的应用使测定抗原的ELISA提高到新水平。
在一步法测定中,应注意钩状效应(hookeffect),类同于沉淀反应中抗原过剩的后带现象。当标本中待测抗原浓度相当高时,过量抗原分别和固相抗体及酶标抗体结合,而不再形成夹心复合物,所得结果将低于实际含量。钩状效应严重时甚至可出现假阴性结果。
(三)间接法测抗体
间接法是检测抗体最常用的方法,其原理为利用酶标记的抗抗体以检测已与固相结合的受检抗体,故称为间接法。操作步骤如下:
(1)将特异性抗原与固相载体连接,形成固相抗原:洗涤除去未结合的抗原及杂质。
(2)加稀释的受检血清:其中的特异抗体与抗原结合,形成固相抗原抗体复合物。经洗涤后,固相载体上只留下特异性抗体。其他免疫球蛋白及血清中的杂质由于不能与固相抗原结合,在洗涤过程中被洗去。
(3)加酶标抗抗体:与固相复合物中的抗体结合,从而使该抗体间接dibiao记上酶。洗涤后,固相载体上的酶量就代表特异性抗体的量。例如欲测人对某种疾病的抗体,可用酶标羊抗人IgG抗体。
(4)加底物显色:颜色深度代表标本中受检抗体的量。
本法只要更换不同的固相抗原,可以用一种酶标抗抗体检测各种与抗原相应的抗体。
(四)竞争法
竞争法可用于测定抗原,也可用于测定抗体。以测定抗原为例,受检抗原和酶标抗原竞争与固相抗体结合,因此结合于固相的酶标抗原量与受检抗原的量呈反比。操作步骤如下:
(1)将特异抗体与固相载体连接,形成固相抗体。洗涤。
(2)待测管中加受检标本和一定量酶标抗原的混合溶液,使之与固相抗体反应。如受检标本中无抗原,则酶标抗原能顺利地与固相抗体结合。如受检标本中含有抗原,则与酶标抗原以同样的机会与固相抗体结合,竞争性地占去了酶标抗原与固相载体结合的机会,使酶标抗原与固相载体的结合量减少。参考管中只加酶标抗原,保温后,酶标抗原与固相抗体的结合可达最充分的量。洗涤。
(3)加底物显色:参考管中由于结合的酶标抗原最多,故颜色最深。参考管颜色深度与待测管颜色深度之差,代表受检标本抗原的量。待测管颜色越淡,表示标本中抗原含量越多。
(五)捕获法测IgM抗体
血清中针对某些抗原的特异性IgM常和特异性IgG同时存在,后者会干扰IgM抗体的测定。因此测定IgM抗本多用捕获法,先将所有血清IgM(包括异性IgM和非特异性IgM)固定在固相上,在去除IgG后再测定特异性IgM。操作步骤如下:
(1)将抗人IgM抗体连接在固相载体上,形成固相抗人IgM。洗涤。
(2)加入稀释的血清标本:保温反应后血清中的IgM抗体被固相抗体捕获。洗涤除去其他免疫球蛋白和血清中的杂质成分。
(3)加入特异性抗原试剂:它只与固相上的特异性IgM结合。洗涤。
(4)加入针对特异性的酶标抗体:使之与结合在固相上的抗原反应结合。洗涤。
(5)加底物显色:如有颜色显示,则表示血清标本中的特异性IgM抗体存在,是为阳性反应。
(六)应用亲和素和生物素的ELISA
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- Western Blot归一化讲座精彩内容提炼
期刊对Western Blot数据要求:
1. 内参和目的蛋白在同一张印迹膜上;
2. zuihao选择膜染色进行总蛋白归一化;
3. 如果使用看家蛋白,需要提供看家蛋白表达稳定并且不受实验条件影响的证据;
4. 成像方法的线性范围需要提供。
看家蛋白一般常用于内参质控,整张膜上的weiyi质控标准,但是看家蛋白一般表达量比较高,可能与目的蛋白不在一个线性范围内,影响定量;并且看家蛋白证明在多种实验条件下是会发生变化,例如:细胞融合,疾病和药物ZL等等,影响定量jingzhun性。
总蛋白质控直接在膜上检测总蛋白,变异性小,误差小,动态范围更宽,使用整个泳道或泳道中大部分信号用于归一化,而不是单一的条带,例如JBC、Nature和Proteomics等期刊推荐使用总蛋白进行归一化。
Azure可提供一站式Western Blot归一化解决方案。
提供两种总蛋白染色试剂Azure Red和TotalStainQ进行膜染色和总蛋白归一化,AzureRed适合低丰度表达样品,TotalStain更适合细胞裂解液样品。
Azure Sapphire双模式多光谱激光成像系统和Azure Imager多功能分子成像系统可进行总蛋白归一化,成像更简单,归一化更方便。
Azure成像系统除了可进行Western Blot成像外,功能非常强大,可进行凝胶、In cell Western孔板成像、2D和2D-DIGE、微阵列芯片、切片、动植物组织、小鼠成像、放射性同位素磷屏成像等。
- ProteinSimple发布单细胞western blot系统
细胞异质性是肿瘤研究,干细胞研究,免疫学研究的极其重要的研究方向。单细胞研究是
分析细胞异质性的主要手段。单细胞组学研究也是jing准医学首要的研究领域。
美国ProteinSimple公司首推基于芯片Western Blot技术,进行单个细胞蛋白质表达水平定量分析系统: Milo.
Milo具有极其强大的功能:
1. 单张芯片进行1000个单细胞western blot
2. 每个单细胞可进行数十个靶蛋白检测
3. 仅需使用Western blot验证抗体,具有抗体通用性
4. 基于western blot技术,蛋白进行分离后检测,提高免疫学检测特异性
5. 全程检测只需4小时
- 蛋白质印迹为什么叫western blot
- 和方位有什么关系吗?还是历史原因?
- western blot为什么用三层滤纸
- western blot转膜时间太长有什么影响
- 了解多样品组织研磨仪工作原理及操作使用步骤的重要性
实验室组织类样品在进行研磨前处理时,往往要将样品分成少量多批次,这样可以尽可能地满足实验检测要求,提高实验效率。为达到这样的效果,我们需要用到多样品组织研磨机。
多样品组织研磨机是高通量组织研磨仪搭配研磨适配器组成的,原本搭载的两个球磨罐,替换成了可装载多个离心管的研磨适配器,以实现少量多批次研磨的目标。
多样品组织研磨机操作步骤:
1、将简单处理的组织样品和适量研磨球放入离心管中,然后将装好样品的离心管放入研磨适配器中。
2、如果样品需要低温研磨,可先将装有样品的适配器放入液氮罐中冷冻降温,几分钟后取出。
3、将冷冻后的研磨适配器放在夹具中间,调整位置后利用自动中心定位的紧固装置和安全锁紧装置进行固定。
4、盖上设备仓盖,通过液晶触摸屏设置振动频率、振动时间。
5、启动设备,开始对样品进行破碎研磨,可从观察窗观察研磨平台运行情况。
6、等待研磨完成,打开仓盖,取出样品,关闭设备。
多样品组织研磨机工作原理:
多样品组织研磨机本质上是二维振动球磨机,其工作区域有两个摇臂,运行时会做高频次的“∞”形横向水平摆动,高速运动的摇臂会带动研磨罐及罐内研磨球,赋予其动能,研磨球对样品进行撞击、挤压和摩擦,实现样品的精细研磨。
相比于常规型号的设备,多样品组织研磨机用研磨适配器替换了研磨罐,从而可以装填更多样品。研磨适配器是类似于离心管架的容器,内部可以放置多个离心管,离心管内部可以放置样品及研磨球。设备运行时,离心管内的研磨球对样品进行撞击、摩擦和挤压,完成样品的精细研磨。
以上就是对多样品组织研磨机的工作原理和操作使用步骤的介绍,多样品组织研磨机对于动物、植物组织样品研磨、生物细胞破壁、DNA/RNA提取都有良好的处理效果,应用领域涵盖农业、食品、生物、环境等多个行业。
- 你的Western Blot实验还ok吗?
做Western Blot的小伙伴,你是不是还在那里熬夜赶实验?是不是还在纠结今天的结果怎么和昨天的差异这么大?是不是在为选择哪种检测方法而烦恼?在为实验的重复性而抓狂?今天小编就和大家聊一下Western Blot中遇到的问题以及应对方法。
归一化问题:
做Western Blot经常需要对蛋白进行归一化,经典的归一化方法是看家蛋白归一化,看家蛋白需要选择在不同样品间稳定表达的蛋白;其次表达丰度也需要筛选,如果丰度过高,目的蛋白丰度与看家蛋白差异过大,那两者检测定量时就不在一个线性范围。这样的筛选过程非常耗时耗力。即使筛选到合适的看家蛋白,对其归一化的过程也需要多次重复调节才可以。
检测灵敏度问题:
小编做Western Blot检测时,由于目的蛋白含量低经常曝光不出来,同时老仪器检测灵敏度不够高,只能不断调整实验,提高上样量,再反复进行摸索,做Western 做到怀疑人生。
蛋白定量重复性问题:
Western Blot检测时,化学发光依赖酶活性和底物浓度,发光信号不稳定,因此定量时容易出现误差,重复性相对较差,也只能不断实验来进行调整和验证。
多个目的蛋白检测问题:
Western Blot检测时,有时需要对多个蛋白进行检测,这时的实验就会变的繁琐,需要对每一个蛋白进行表达检测,剪膜,剥离膜经常要做,但是经过这些步骤又会影响定量的JZ性,小编也很为难。
那么上述问题有没有好的解决方法呢?这里悄悄告诉大家一个好消息,采用Sapphire双模式多光谱成像系统,可以很好的解决上述困扰,好文章也在向你招手。
Sapphire成像系统采用双模式,既有扫描式又有CCD成像式;多达四激光激发用于荧光成像,每个通道配有自己独立的检测器,PMT检测器用于蓝光成像,3个APD检测分别用于绿光、红光和近红外检测,高分辨率CCD用于化学发光检测,在全光谱范围内避免信号损失;动态范围可达6log;软件操作简单,易于上手。
应对均一化问题,已有众多期刊建议采用总蛋白均一化,总蛋白均一化能够更加真实的反应目的蛋白表达量的变化,同时也无需繁琐的筛选看家蛋白、调整蛋白上样,只需对总蛋白进行染色和调整,Azure提供总蛋白归一化试剂和相应的AzureSpot分析软件,轻松搞定蛋白均一化问题 。
应对低丰度蛋白检测问题,Sapphire双模式多光谱成像系统可以加配610万像素,大光圈的优质CCD检测器,其检测灵敏度可以达到fg级,动态范围是传统胶片的4倍。可以进行累积曝光,可以快速得到你需要的图像,无需多次重复和改变上样。
应对重复性问题,荧光检测方法与传统的化学发光不同,荧光检测方法不依赖酶活性和底物,二抗标记荧光基团,信号强度和上样量成线性关系,信号持久,可以得到更好的重复性结果,实验可以快速完成。
应对多种蛋白检测问题,荧光检测的一个好处是,无需剥离和重孵育,即可在一张印迹膜上进行多种蛋白的检测,减少蛋白变化的误差,实现jingzhun定量。
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无需再为Western实验所累
- western blot的枪头需要高压吗
- Western Blot归一化:看家蛋白or总蛋白
做Western Blot的小伙伴,是不是还在为归一化方法而纠结呢?今天小编就和大家汇总一下看家蛋白和总蛋白归一化的方法。
看家蛋白归一化
使用看家蛋白的缺点是在样品间和不同条件下表达水平可能不一致。如使用看家蛋白进行标准化,必须先花费时间和精力来验证内参的选择。
使用看家蛋白的第二个重大挑战是它们的表达丰度很高,如果样品中的看家蛋白表达非常高,这会限制在凝胶上加载的样品量,如果感兴趣的蛋白不是同样的表达丰度,那这两种蛋白质就不在同一线性检测范围内。
如果您正在进行多重蛋白印迹,例如比较同一蛋白质的磷酸化和非磷酸化形式,则需要考虑的第三个挑战是从不同物种中产生一抗和二抗的复杂性。
检测的看家蛋白可能干扰感兴趣蛋白的检测。理想情况下,看家蛋白应该与感兴趣蛋白的大小不同,因此这两种蛋白可在印迹上空间分辨。当实验在同一印迹上检查多种目的蛋白时,这就变得越来越困难。
总蛋白归一化
使用总蛋白归一化,是直接在膜上检测总蛋白,并且该值在归一化时用作分母。总蛋白染色提供更宽的动态范围,并且表现出比看家蛋白更低的可变性和更准确的定量数据。
与使用看家蛋白相比,图像采集后的分析工作流程基本不变; 整个泳道或泳道中大部分信号用于归一化,而不是单一的条带。
例如:JBC、Narute和Proteomics等期刊会推荐使用总蛋白归一化方法。
使用总蛋白染色剂对膜进行染色提供了质控优势,可以验证转印是否完全。
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- western blot和流式细胞术哪个更好
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