揭秘面纱 | 潜伏的 “杀手”伊丽莎白菌,布鲁克方案快速应对院感暴发
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布鲁克方案对伊丽莎白菌的院感检测应用
该研究分析了西班牙马德里的格雷戈里奥·马拉尼翁大学医院在2020年4月至2021年7月期间分离到的26株伊丽莎白菌分离株,其中23株来自临床样本,3株来自环境样本。首先使用MALDI Biotyper鉴定菌株,并进行抗菌药物敏感性测试,然后使用IR Biotyper和cgMLST进行分型。
实验结果
MALDI Biotyper的鉴定结果为25株和平空间站伊丽莎白菌(E. miricola)和1株按蚊伊丽莎白菌(E. anophelis)。所有伊丽莎白菌分离株均对五种抗菌药物具有耐药性,至少80%的分离株对头孢他啶、庆大霉素、头孢吡肟、多粘菌素和阿米卡星耐药。
IR Biotyper和cgMLST结果显示,22个分离株都与暴发有关,两种方法之间只有一株菌的分类结果不一致:IR Biotyper判定分离株eli5是暴发相关的,而cgMLST判定其是暴发无关的。
图1. 26株菌的IR Biotyper 分析结果:A) HCA聚类分析树状图,垂直线表示 IR Biotyper 软件自动产生的区分暴发菌株与非暴发菌株的cut off值(0.983);B)PCA主成分分析图。
图2. cgMLST 建立的最小生成树。
小结
通过MALDI Biotyper与IR Biotyper联用,在正确识别出菌株菌种信息后,IR Biotyper可以快速区分所有与暴发有关的分离株,表明IR Biotyper有助于快速和准确地分析由和平空间站伊丽莎白菌引起的暴发,为临床微生物实验室提供一种新的工具,能够更有效地应对和管理医院内的感染暴发。
参考文献:
Rodríguez-Temporal D, García-Ca?ada JE, Candela A, et al. Characterization of an outbreak caused by Elizabethkingia miricola using Fourier-transform infrared (FTIR) spectroscopy. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 2024;43(4):797-803. doi:10.1007/s10096-024-04764-4
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